More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1639 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  47.93 
 
 		 898 aa  787    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.06 
 
 		 708 aa  691    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  57.18 
 
 		 832 aa  1019    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  62.47 
 
 		 904 aa  1066    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.72 
 
 		 697 aa  703    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  61.45 
 
 		 914 aa  1082    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  52.18 
 
 		 897 aa  887    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  56.76 
 
 		 977 aa  934    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 859 aa  1754    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  53.58 
 
 		 906 aa  889    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  53.81 
 
 		 864 aa  875    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  58.92 
 
 		 846 aa  1038    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  41.88 
 
 		 703 aa  483  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  39.21 
 
 		 626 aa  446  1.0000000000000001e-124  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  40.95 
 
 		 490 aa  332  3e-89  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  36.97 
 
 		 922 aa  208  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  36.97 
 
 		 934 aa  208  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  36.13 
 
 		 923 aa  208  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2042  DNA gyrase subunit A  35.9 
 
 		 893 aa  208  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.430376  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2123  DNA gyrase subunit A  35.61 
 
 		 893 aa  207  6e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  37.9 
 
 		 748 aa  207  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  37.9 
 
 		 748 aa  207  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  33.56 
 
 		 745 aa  206  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  37.37 
 
 		 748 aa  204  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  31.03 
 
 		 840 aa  203  9e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  37.23 
 
 		 751 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  34.69 
 
 		 828 aa  202  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15810  DNA gyrase subunit A  34.28 
 
 		 910 aa  201  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.872955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  36.13 
 
 		 750 aa  201  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  30.44 
 
 		 848 aa  200  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  38.01 
 
 		 753 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  38.19 
 
 		 748 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1848  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 922 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409783  normal  0.837325 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  34.43 
 
 		 806 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  30.68 
 
 		 898 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  32.69 
 
 		 856 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  32.62 
 
 		 775 aa  199  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  32.09 
 
 		 750 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  32.99 
 
 		 830 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  34.82 
 
 		 807 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  34.3 
 
 		 750 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  34.52 
 
 		 923 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  33.62 
 
 		 904 aa  199  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  31.78 
 
 		 855 aa  198  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3947  DNA gyrase subunit A  34.52 
 
 		 919 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00094025  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1358  DNA gyrase subunit A  34.52 
 
 		 921 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.832857  normal  0.422434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  34.35 
 
 		 811 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  30.67 
 
 		 833 aa  197  5.000000000000001e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  33.51 
 
 		 818 aa  198  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  34.69 
 
 		 748 aa  197  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  27.8 
 
 		 853 aa  197  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  36.1 
 
 		 753 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  34.27 
 
 		 748 aa  197  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0413  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 824 aa  196  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0903108  decreased coverage  0.000217687 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  35.81 
 
 		 816 aa  196  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  34.38 
 
 		 928 aa  197  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  36.44 
 
 		 753 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  37.13 
 
 		 796 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  35.2 
 
 		 749 aa  196  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  36.07 
 
 		 809 aa  196  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00734  DNA gyrase subunit A  32.76 
 
 		 898 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.942934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  30.64 
 
 		 893 aa  195  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  33.71 
 
 		 913 aa  196  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  36.72 
 
 		 767 aa  196  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  29.72 
 
 		 825 aa  196  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  29.71 
 
 		 752 aa  196  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3865  DNA gyrase subunit A  28.89 
 
 		 913 aa  196  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  28.51 
 
 		 862 aa  195  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1286  DNA gyrase, A subunit  35.95 
 
 		 873 aa  195  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0493  DNA gyrase subunit A  34.77 
 
 		 900 aa  194  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014374  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1170  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  35.92 
 
 		 793 aa  195  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000163791  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1595  DNA topoisomerase IV subunit A  31.59 
 
 		 758 aa  194  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2539  DNA topoisomerase IV subunit A  31.37 
 
 		 770 aa  194  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1374  DNA gyrase subunit A  33.97 
 
 		 923 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  36 
 
 		 748 aa  194  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  35.36 
 
 		 812 aa  194  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  31.06 
 
 		 889 aa  194  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  34.27 
 
 		 899 aa  194  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  31.06 
 
 		 889 aa  194  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  34.69 
 
 		 870 aa  194  6e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0754  DNA topoisomerase IV subunit A  33.08 
 
 		 770 aa  194  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.92701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  35.22 
 
 		 749 aa  194  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  35.93 
 
 		 767 aa  194  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0007  DNA gyrase subunit A  30.46 
 
 		 910 aa  193  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  28.87 
 
 		 809 aa  193  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  28.95 
 
 		 834 aa  193  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  30.23 
 
 		 809 aa  193  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1961  DNA gyrase subunit A  33.43 
 
 		 921 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.844346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  35.19 
 
 		 832 aa  193  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  32.35 
 
 		 839 aa  193  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23260  DNA gyrase subunit A  33.43 
 
 		 921 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1287  DNA gyrase subunit A  34.72 
 
 		 907 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  30.29 
 
 		 857 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1745  DNA gyrase, subunit A  32.8 
 
 		 928 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.6885  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1049  DNA gyrase, A subunit  30.07 
 
 		 838 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385966  normal  0.255523 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2630  DNA gyrase subunit A  34.72 
 
 		 907 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  35.9 
 
 		 777 aa  192  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  35.67 
 
 		 758 aa  192  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0540  DNA gyrase subunit A  36.14 
 
 		 930 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0267481  normal  0.364195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  30.98 
 
 		 816 aa  192  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>