More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0441 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  50.83 
 
 		 898 aa  831    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  66.1 
 
 		 897 aa  1122    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.65 
 
 		 697 aa  706    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 864 aa  1768    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.07 
 
 		 904 aa  843    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  72.45 
 
 		 906 aa  1228    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  53.12 
 
 		 914 aa  901    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  52.54 
 
 		 832 aa  870    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  53.25 
 
 		 859 aa  897    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  57.67 
 
 		 977 aa  953    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.57 
 
 		 708 aa  687    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  55.33 
 
 		 846 aa  929    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  43.15 
 
 		 703 aa  493  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  38.33 
 
 		 626 aa  454  1.0000000000000001e-126  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  39.61 
 
 		 490 aa  324  5e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  28.64 
 
 		 853 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  28.91 
 
 		 828 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  29.59 
 
 		 807 aa  209  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  38.21 
 
 		 922 aa  208  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  37.01 
 
 		 923 aa  207  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  29.79 
 
 		 834 aa  206  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  37.91 
 
 		 934 aa  206  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  28.4 
 
 		 796 aa  205  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  29.6 
 
 		 898 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  33.97 
 
 		 818 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  33.97 
 
 		 839 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  26.68 
 
 		 817 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  33.97 
 
 		 839 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  33.7 
 
 		 825 aa  201  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2042  DNA gyrase subunit A  35.03 
 
 		 893 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.430376  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2123  DNA gyrase subunit A  35.03 
 
 		 893 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  32.85 
 
 		 808 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  30.16 
 
 		 806 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  29.56 
 
 		 932 aa  199  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  27.66 
 
 		 823 aa  198  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  35.14 
 
 		 904 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  32.25 
 
 		 889 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  32.25 
 
 		 889 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  26.73 
 
 		 836 aa  197  6e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  28.79 
 
 		 813 aa  197  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  26.87 
 
 		 819 aa  197  8.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4482  DNA gyrase, A subunit  28.42 
 
 		 906 aa  197  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0493  DNA gyrase subunit A  36.75 
 
 		 900 aa  197  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3009  DNA gyrase subunit A  27.91 
 
 		 878 aa  197  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.354996  normal  0.0330044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  27.49 
 
 		 823 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  27.49 
 
 		 823 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  27.49 
 
 		 823 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  28.72 
 
 		 835 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  27.49 
 
 		 823 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  27.49 
 
 		 823 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  32.29 
 
 		 823 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4501  DNA gyrase, A subunit  28.25 
 
 		 907 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  32.29 
 
 		 823 aa  196  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  32.45 
 
 		 814 aa  196  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  28.29 
 
 		 809 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  32.03 
 
 		 823 aa  195  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  30.49 
 
 		 883 aa  195  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  29.13 
 
 		 827 aa  195  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  27.91 
 
 		 882 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  34.04 
 
 		 811 aa  194  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  28.72 
 
 		 815 aa  194  6e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00734  DNA gyrase subunit A  34.23 
 
 		 898 aa  194  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.942934  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1632  DNA gyrase subunit A  35.29 
 
 		 866 aa  194  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  35.05 
 
 		 809 aa  194  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2888  DNA gyrase subunit A  35.29 
 
 		 866 aa  194  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  33.14 
 
 		 928 aa  194  8e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0435  DNA gyrase subunit A  35.29 
 
 		 866 aa  194  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0738  DNA gyrase subunit A  34.55 
 
 		 859 aa  194  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.958835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0195  DNA gyrase subunit A  35.29 
 
 		 866 aa  194  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3000  DNA gyrase subunit A  35.29 
 
 		 866 aa  194  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2951  DNA gyrase subunit A  35.29 
 
 		 866 aa  194  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0953  DNA gyrase subunit A  35.29 
 
 		 866 aa  194  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.665662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  32.2 
 
 		 848 aa  194  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2578  DNA gyrase subunit A  35.29 
 
 		 888 aa  193  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  28.67 
 
 		 827 aa  194  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4346  DNA gyrase subunit A  28.25 
 
 		 907 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1848  DNA gyrase subunit A  34.17 
 
 		 922 aa  193  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409783  normal  0.837325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 912 aa  193  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1620  DNA gyrase subunit A  34.27 
 
 		 881 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0540  DNA gyrase subunit A  37.05 
 
 		 930 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0267481  normal  0.364195 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2474  DNA gyrase, A subunit  28.8 
 
 		 805 aa  192  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000172995  decreased coverage  0.00702489 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1315  DNA gyrase subunit A  36.14 
 
 		 902 aa  192  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000857491  decreased coverage  3.4629599999999997e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  26.71 
 
 		 812 aa  192  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  27.05 
 
 		 821 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  33.98 
 
 		 913 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  28.98 
 
 		 949 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1049  DNA gyrase, A subunit  28.55 
 
 		 838 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385966  normal  0.255523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15810  DNA gyrase subunit A  33.89 
 
 		 910 aa  192  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.872955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1571  DNA gyrase subunit A  34.23 
 
 		 880 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612234  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1170  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  35.07 
 
 		 793 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000163791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0920  DNA gyrase subunit A  34.83 
 
 		 867 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0820357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1241  DNA gyrase subunit A  34.92 
 
 		 931 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.998227  normal  0.707625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0916  DNA gyrase subunit A  34.83 
 
 		 867 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  29.86 
 
 		 870 aa  191  4e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  32.97 
 
 		 893 aa  191  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  28.9 
 
 		 870 aa  191  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  34.35 
 
 		 818 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  31.51 
 
 		 823 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5084  DNA gyrase, A subunit  33.8 
 
 		 908 aa  191  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  32.79 
 
 		 802 aa  191  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>