More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2475 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  70.98 
 
 		 864 aa  1221    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  52.38 
 
 		 898 aa  855    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  65.72 
 
 		 897 aa  1142    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  53.57 
 
 		 832 aa  904    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  56.1 
 
 		 914 aa  936    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.28 
 
 		 697 aa  676    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 906 aa  1843    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  54.28 
 
 		 846 aa  902    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.85 
 
 		 904 aa  877    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  54 
 
 		 859 aa  906    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.69 
 
 		 708 aa  674    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  59.42 
 
 		 977 aa  973    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  41.48 
 
 		 703 aa  464  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  39.03 
 
 		 626 aa  453  1.0000000000000001e-126  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  37.5 
 
 		 490 aa  316  9.999999999999999e-85  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  31.71 
 
 		 893 aa  204  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  30.89 
 
 		 889 aa  200  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  30.89 
 
 		 889 aa  200  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1049  DNA gyrase, A subunit  30.17 
 
 		 838 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385966  normal  0.255523 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  28.77 
 
 		 839 aa  197  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  28.77 
 
 		 839 aa  194  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  27.26 
 
 		 882 aa  194  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  31.46 
 
 		 818 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3009  DNA gyrase subunit A  27.1 
 
 		 878 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.354996  normal  0.0330044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  34.99 
 
 		 865 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  30.35 
 
 		 834 aa  192  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2888  DNA gyrase subunit A  29.06 
 
 		 866 aa  190  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0435  DNA gyrase subunit A  29.06 
 
 		 866 aa  190  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0953  DNA gyrase subunit A  29.06 
 
 		 866 aa  190  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.665662  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3000  DNA gyrase subunit A  29.06 
 
 		 866 aa  190  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  30.98 
 
 		 806 aa  190  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2951  DNA gyrase subunit A  29.06 
 
 		 866 aa  190  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0195  DNA gyrase subunit A  29.06 
 
 		 866 aa  190  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2578  DNA gyrase subunit A  29.06 
 
 		 888 aa  190  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  33.8 
 
 		 923 aa  189  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1272  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  34.66 
 
 		 775 aa  189  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972019  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  29.12 
 
 		 875 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  28.52 
 
 		 796 aa  189  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  35.54 
 
 		 848 aa  188  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1315  DNA gyrase subunit A  33.15 
 
 		 902 aa  187  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000857491  decreased coverage  3.4629599999999997e-25 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  30.72 
 
 		 827 aa  187  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  33.24 
 
 		 788 aa  187  8e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  34.36 
 
 		 922 aa  187  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  29.51 
 
 		 821 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  29.36 
 
 		 828 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2790  DNA gyrase subunit A  34.92 
 
 		 889 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0140578  hitchhiker  0.00260367 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  34.08 
 
 		 934 aa  187  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  28.47 
 
 		 807 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  28.29 
 
 		 883 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  28.47 
 
 		 949 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4482  DNA gyrase, A subunit  29.69 
 
 		 906 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1848  DNA gyrase subunit A  32.24 
 
 		 922 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409783  normal  0.837325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0493  DNA gyrase subunit A  32.87 
 
 		 900 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1571  DNA gyrase subunit A  32.31 
 
 		 880 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3041  DNA gyrase subunit A  32.14 
 
 		 883 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.894078  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  28.55 
 
 		 898 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  33.6 
 
 		 811 aa  185  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4501  DNA gyrase, A subunit  29.48 
 
 		 907 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  32.08 
 
 		 817 aa  185  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  34.41 
 
 		 819 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4719  DNA gyrase subunit A  31.48 
 
 		 888 aa  185  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.902316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  33.15 
 
 		 864 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  30.9 
 
 		 870 aa  185  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  32.24 
 
 		 848 aa  185  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1795  DNA gyrase subunit A  34.36 
 
 		 880 aa  184  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979791  unclonable  0.00000642236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3280  DNA gyrase subunit A  33.15 
 
 		 886 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.586239  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  33.97 
 
 		 809 aa  184  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  28.83 
 
 		 828 aa  184  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1632  DNA gyrase subunit A  32.03 
 
 		 866 aa  184  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  32.22 
 
 		 904 aa  184  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2264  DNA gyrase subunit A  28.46 
 
 		 867 aa  184  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0738  DNA gyrase subunit A  27.99 
 
 		 859 aa  184  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.958835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0771  DNA gyrase subunit A  27.82 
 
 		 889 aa  184  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.380841  hitchhiker  0.00768544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  32.8 
 
 		 809 aa  184  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0842  DNA gyrase subunit A  27.82 
 
 		 889 aa  184  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18082  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2151  DNA gyrase, A subunit  29.38 
 
 		 834 aa  183  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0959  DNA gyrase subunit A  31.75 
 
 		 885 aa  183  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1396  DNA gyrase subunit A  28.29 
 
 		 877 aa  183  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.431905  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  28.6 
 
 		 831 aa  183  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  30.32 
 
 		 825 aa  183  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0540  DNA gyrase subunit A  34.53 
 
 		 930 aa  183  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0267481  normal  0.364195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15810  DNA gyrase subunit A  31.87 
 
 		 910 aa  183  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.872955  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  31.72 
 
 		 836 aa  183  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  26.02 
 
 		 853 aa  183  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  28.95 
 
 		 823 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  28.95 
 
 		 823 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  28.95 
 
 		 823 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  28.95 
 
 		 823 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  28.95 
 
 		 823 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  31.82 
 
 		 835 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  34.2 
 
 		 809 aa  182  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0920  DNA gyrase subunit A  28.6 
 
 		 867 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0820357 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  28.95 
 
 		 823 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4346  DNA gyrase subunit A  29.07 
 
 		 907 aa  183  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  32.25 
 
 		 830 aa  182  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  33.24 
 
 		 796 aa  182  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  27.44 
 
 		 911 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0916  DNA gyrase subunit A  28.6 
 
 		 867 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1040  DNA gyrase subunit A  28.79 
 
 		 867 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  32.79 
 
 		 833 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>