More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09723 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  48.94 
 
 		 898 aa  814    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  67.03 
 
 		 906 aa  1149    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53 
 
 		 904 aa  873    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  52.89 
 
 		 832 aa  878    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 897 aa  1837    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  55.21 
 
 		 846 aa  951    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.2 
 
 		 708 aa  693    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  52.11 
 
 		 859 aa  906    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  53.87 
 
 		 914 aa  920    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  53.87 
 
 		 977 aa  927    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.12 
 
 		 697 aa  724    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  66.14 
 
 		 864 aa  1117    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  40.76 
 
 		 703 aa  496  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  37.76 
 
 		 626 aa  443  1e-123  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  39.79 
 
 		 490 aa  331  4e-89  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  30.14 
 
 		 818 aa  209  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  28.55 
 
 		 807 aa  209  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  30.92 
 
 		 796 aa  209  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  30.36 
 
 		 889 aa  209  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  30.36 
 
 		 889 aa  209  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  30.36 
 
 		 893 aa  208  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1049  DNA gyrase, A subunit  29.13 
 
 		 838 aa  208  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385966  normal  0.255523 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  31.09 
 
 		 898 aa  205  3e-51  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  28.57 
 
 		 853 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  27.36 
 
 		 839 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  29.89 
 
 		 839 aa  201  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  31.25 
 
 		 834 aa  200  7.999999999999999e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  31.04 
 
 		 825 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  30.97 
 
 		 802 aa  198  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  31.42 
 
 		 811 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  31.07 
 
 		 818 aa  197  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  35.16 
 
 		 865 aa  197  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2024  DNA gyrase, A subunit  29.12 
 
 		 841 aa  196  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  32.08 
 
 		 748 aa  196  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  32.08 
 
 		 748 aa  196  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  35.71 
 
 		 807 aa  194  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  32.75 
 
 		 809 aa  194  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2151  DNA gyrase, A subunit  27.38 
 
 		 834 aa  194  6e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  38.9 
 
 		 750 aa  194  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  31.66 
 
 		 748 aa  193  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  36.02 
 
 		 806 aa  193  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  29.12 
 
 		 809 aa  192  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1272  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  34.57 
 
 		 775 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972019  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  36.75 
 
 		 923 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  33.98 
 
 		 788 aa  192  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  28.89 
 
 		 828 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5027  DNA gyrase, A subunit  31.18 
 
 		 911 aa  191  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.0567458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4567  DNA gyrase, A subunit  31.18 
 
 		 911 aa  191  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.205833 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  29.93 
 
 		 819 aa  191  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  29.42 
 
 		 879 aa  191  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  30.8 
 
 		 809 aa  190  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  31.92 
 
 		 748 aa  190  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5084  DNA gyrase, A subunit  29.37 
 
 		 908 aa  190  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  27.63 
 
 		 875 aa  190  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  33.57 
 
 		 748 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  30.45 
 
 		 796 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  31 
 
 		 815 aa  189  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  28.43 
 
 		 823 aa  189  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2474  DNA gyrase, A subunit  29.37 
 
 		 805 aa  189  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000172995  decreased coverage  0.00702489 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  28.43 
 
 		 823 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  28.43 
 
 		 823 aa  189  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  28.89 
 
 		 840 aa  189  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  33.6 
 
 		 870 aa  189  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  28.43 
 
 		 823 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  27.63 
 
 		 821 aa  189  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  30.42 
 
 		 814 aa  189  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  34.81 
 
 		 848 aa  189  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  28.43 
 
 		 823 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  28.43 
 
 		 823 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  29.46 
 
 		 823 aa  188  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  30.69 
 
 		 852 aa  189  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  33.93 
 
 		 836 aa  189  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  29.79 
 
 		 829 aa  188  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  29.69 
 
 		 823 aa  188  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  30.55 
 
 		 856 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  36.12 
 
 		 928 aa  188  5e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  36.45 
 
 		 922 aa  187  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  29.91 
 
 		 823 aa  187  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  30.23 
 
 		 814 aa  187  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  27.62 
 
 		 865 aa  187  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  30.54 
 
 		 816 aa  187  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  29.45 
 
 		 820 aa  187  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  30.15 
 
 		 809 aa  187  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  36.45 
 
 		 934 aa  187  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  37.46 
 
 		 749 aa  187  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  28.6 
 
 		 823 aa  187  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  31.64 
 
 		 817 aa  187  8e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  33.33 
 
 		 748 aa  187  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  30.59 
 
 		 838 aa  187  9e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  34.07 
 
 		 899 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  28.68 
 
 		 870 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  28.5 
 
 		 827 aa  187  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  29.49 
 
 		 827 aa  187  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1170  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  34.34 
 
 		 793 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000163791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2730  DNA gyrase, A subunit  27.6 
 
 		 819 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  26.56 
 
 		 949 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  30.16 
 
 		 835 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  33.33 
 
 		 855 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  38.23 
 
 		 753 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2790  DNA gyrase subunit A  35.21 
 
 		 889 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0140578  hitchhiker  0.00260367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>