More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0103 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  52.2 
 
 		 897 aa  677    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  51.57 
 
 		 864 aa  665    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  52.13 
 
 		 846 aa  683    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 708 aa  1458    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.02 
 
 		 697 aa  670    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  52.06 
 
 		 859 aa  691    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  49.69 
 
 		 906 aa  658    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  51.59 
 
 		 914 aa  691    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.48 
 
 		 904 aa  666    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  50.23 
 
 		 832 aa  672    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  48.44 
 
 		 977 aa  627  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  48.98 
 
 		 898 aa  622  1e-177  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  42.43 
 
 		 703 aa  478  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  36.46 
 
 		 626 aa  447  1.0000000000000001e-124  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  41.65 
 
 		 490 aa  348  2e-94  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  30.69 
 
 		 809 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  29.88 
 
 		 824 aa  213  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  31.82 
 
 		 827 aa  210  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1272  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  31.46 
 
 		 775 aa  206  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  31.97 
 
 		 823 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  29.59 
 
 		 816 aa  204  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  32.71 
 
 		 823 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  27.91 
 
 		 806 aa  201  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  30.51 
 
 		 813 aa  201  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  31.1 
 
 		 809 aa  200  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  28.3 
 
 		 839 aa  200  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  31.49 
 
 		 807 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  31.49 
 
 		 898 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  31.47 
 
 		 820 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  31.48 
 
 		 825 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  31.3 
 
 		 834 aa  198  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  28.65 
 
 		 818 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2135  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  35.41 
 
 		 787 aa  197  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  29.96 
 
 		 828 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1049  DNA gyrase, A subunit  34.44 
 
 		 838 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385966  normal  0.255523 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  30.12 
 
 		 788 aa  196  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  32.85 
 
 		 808 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  30.82 
 
 		 819 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  34.23 
 
 		 819 aa  194  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  33.79 
 
 		 751 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  30.83 
 
 		 839 aa  194  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  35.71 
 
 		 811 aa  194  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  32.36 
 
 		 870 aa  194  5e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  29.32 
 
 		 856 aa  194  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  26.73 
 
 		 796 aa  194  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  36.96 
 
 		 912 aa  194  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  29.37 
 
 		 815 aa  193  7e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0795  DNA gyrase, A subunit  35.46 
 
 		 823 aa  193  8e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  30.83 
 
 		 839 aa  193  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  31.89 
 
 		 893 aa  193  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  27.61 
 
 		 807 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1166  DNA gyrase subunit A  37.21 
 
 		 904 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0659198  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1238  DNA gyrase, A subunit  31.32 
 
 		 813 aa  192  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  31.59 
 
 		 814 aa  192  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1170  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  34.04 
 
 		 793 aa  192  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000163791  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  29.66 
 
 		 927 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  35.18 
 
 		 853 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  36.71 
 
 		 828 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  31.89 
 
 		 923 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  29.73 
 
 		 796 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1287  DNA gyrase subunit A  37.21 
 
 		 907 aa  191  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2630  DNA gyrase subunit A  37.21 
 
 		 907 aa  191  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  33.88 
 
 		 750 aa  191  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  30.52 
 
 		 821 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  34.93 
 
 		 913 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2163  DNA gyrase, A subunit  29.9 
 
 		 869 aa  190  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.612528 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  29.87 
 
 		 812 aa  190  8e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  33.14 
 
 		 752 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  35.48 
 
 		 913 aa  189  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  33.08 
 
 		 855 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  31.26 
 
 		 836 aa  189  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  33.95 
 
 		 817 aa  189  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0413  DNA gyrase subunit A  34.81 
 
 		 824 aa  189  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0903108  decreased coverage  0.000217687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  29.9 
 
 		 823 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  37.13 
 
 		 831 aa  189  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0007  DNA gyrase subunit A  31.35 
 
 		 922 aa  189  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  29.9 
 
 		 823 aa  188  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  35 
 
 		 835 aa  188  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  32.94 
 
 		 753 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  29.58 
 
 		 823 aa  188  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  31.3 
 
 		 848 aa  188  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  31.36 
 
 		 928 aa  188  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  30.52 
 
 		 823 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2267  DNA gyrase, A subunit  33.33 
 
 		 938 aa  187  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525692  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  35.14 
 
 		 840 aa  187  4e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  35.1 
 
 		 743 aa  188  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  33.33 
 
 		 753 aa  188  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  31.03 
 
 		 911 aa  188  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  33.87 
 
 		 866 aa  187  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0493  DNA gyrase subunit A  32.98 
 
 		 900 aa  187  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014374  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  33.68 
 
 		 830 aa  187  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  33.01 
 
 		 753 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0371  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  36.11 
 
 		 766 aa  187  6e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  29.69 
 
 		 823 aa  187  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  31.5 
 
 		 889 aa  187  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  31.5 
 
 		 889 aa  187  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  29.69 
 
 		 823 aa  187  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  28.94 
 
 		 802 aa  187  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  29.69 
 
 		 823 aa  187  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  29.69 
 
 		 823 aa  187  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>