More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3303 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1681  DNA topoisomerase IV subunit A  55.75 
 
 		 827 aa  807    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.638406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1693  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  61.22 
 
 		 826 aa  928    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0385634  normal  0.564105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2281  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.56 
 
 		 1143 aa  746    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1618  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  69.89 
 
 		 833 aa  1092    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7080  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  66.42 
 
 		 831 aa  1060    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  76.55 
 
 		 831 aa  1290    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1772  DNA topoisomerase IV subunit A  64.6 
 
 		 820 aa  1031    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 828 aa  1655    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15900  DNA topoisomerase IV subunit A  62.84 
 
 		 823 aa  993    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0201184  normal  0.219646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2387  DNA topoisomerase  66.34 
 
 		 841 aa  1043    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0699814  normal  0.399735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1934  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  57.44 
 
 		 855 aa  911    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.621213  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0699  DNA gyrase/topoisomerase IV, A subunit  50.06 
 
 		 887 aa  781    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08230  DNA topoisomerase IV subunit A  56.74 
 
 		 827 aa  837    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1675  DNA topoisomerase IV subunit A  55.69 
 
 		 827 aa  794    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.898685 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0303  DNA topoisomerase IV subunit A  49.94 
 
 		 909 aa  825    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.821853  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13190  DNA topoisomerase IV subunit A  55.72 
 
 		 868 aa  874    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14430  DNA topoisomerase IV subunit A  59.59 
 
 		 822 aa  914    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0776832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1627  DNA topoisomerase IV subunit A  60.57 
 
 		 832 aa  983    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1546  DNA topoisomerase IV subunit A  59.78 
 
 		 826 aa  903    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0628876  normal  0.0572906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  58.41 
 
 		 828 aa  944    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.121142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1422  DNA topoisomerase IV subunit A  60.7 
 
 		 813 aa  958    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2949  DNA topoisomerase IV subunit A  62.14 
 
 		 826 aa  963    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0430579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1621  DNA topoisomerase IV subunit A  60.14 
 
 		 836 aa  979    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000739384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16040  DNA topoisomerase IV subunit A  61.1 
 
 		 824 aa  957    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1928  DNA topoisomerase IV subunit A  60.22 
 
 		 819 aa  910    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.769322  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  42.99 
 
 		 824 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 839 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 839 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  43.04 
 
 		 837 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  42.69 
 
 		 812 aa  551  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  40.26 
 
 		 820 aa  549  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  41.54 
 
 		 823 aa  548  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  39.07 
 
 		 828 aa  545  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  41.41 
 
 		 823 aa  542  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  42.43 
 
 		 834 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  39.9 
 
 		 830 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  41 
 
 		 834 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  40.37 
 
 		 818 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  40.9 
 
 		 901 aa  536  1e-151  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  41.22 
 
 		 811 aa  536  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  39.76 
 
 		 818 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  39.29 
 
 		 848 aa  536  1e-151  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  42.76 
 
 		 839 aa  539  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  40 
 
 		 809 aa  533  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  39.45 
 
 		 893 aa  534  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  42.36 
 
 		 839 aa  535  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  41.15 
 
 		 848 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  41.83 
 
 		 875 aa  535  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  38.82 
 
 		 821 aa  535  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  37.57 
 
 		 949 aa  531  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  39.08 
 
 		 889 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  41.45 
 
 		 802 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  40.26 
 
 		 809 aa  531  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  39.08 
 
 		 889 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  39.31 
 
 		 848 aa  531  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  37.81 
 
 		 875 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  39.16 
 
 		 807 aa  529  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  37.61 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  37.61 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  38.73 
 
 		 825 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  37.83 
 
 		 814 aa  528  1e-148  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  41.12 
 
 		 841 aa  527  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  40.19 
 
 		 932 aa  526  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  38.09 
 
 		 807 aa  526  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  37.61 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  40.11 
 
 		 866 aa  528  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  40.45 
 
 		 796 aa  526  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  41.96 
 
 		 834 aa  528  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  39.87 
 
 		 809 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  37.48 
 
 		 823 aa  525  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  38.69 
 
 		 834 aa  524  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  37.48 
 
 		 823 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  37.48 
 
 		 823 aa  525  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  39.97 
 
 		 812 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  38.12 
 
 		 838 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  39.43 
 
 		 870 aa  525  1e-147  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  37.48 
 
 		 823 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  38.16 
 
 		 823 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  37.48 
 
 		 823 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  38.59 
 
 		 809 aa  524  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  40.9 
 
 		 806 aa  523  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  38.31 
 
 		 836 aa  525  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0007  DNA gyrase, A subunit  41.91 
 
 		 839 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  38.55 
 
 		 823 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  38.39 
 
 		 819 aa  521  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0006  DNA gyrase, A subunit  44.83 
 
 		 816 aa  522  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400994  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  39.5 
 
 		 855 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  40.65 
 
 		 827 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0007  DNA gyrase subunit A  41.75 
 
 		 875 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876673  normal  0.542792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  36.62 
 
 		 796 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0008  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  40.92 
 
 		 836 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1431  DNA gyrase subunit A  39.27 
 
 		 883 aa  521  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  39.72 
 
 		 808 aa  521  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0007  DNA gyrase subunit A  39.24 
 
 		 836 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0674911 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  39.6 
 
 		 809 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  38.44 
 
 		 819 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  41.31 
 
 		 831 aa  519  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  38.43 
 
 		 827 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  39.03 
 
 		 856 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  40.36 
 
 		 816 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>