More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1621  DNA topoisomerase IV subunit A  53.07 
 
 		 836 aa  840    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000739384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14430  DNA topoisomerase IV subunit A  55.34 
 
 		 822 aa  815    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0776832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1681  DNA topoisomerase IV subunit A  79.47 
 
 		 827 aa  1311    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.638406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16040  DNA topoisomerase IV subunit A  54.97 
 
 		 824 aa  831    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  56.77 
 
 		 828 aa  853    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  56.77 
 
 		 831 aa  863    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1546  DNA topoisomerase IV subunit A  56.2 
 
 		 826 aa  809    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0628876  normal  0.0572906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1928  DNA topoisomerase IV subunit A  55.64 
 
 		 819 aa  813    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.769322  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2387  DNA topoisomerase  59.8 
 
 		 841 aa  877    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0699814  normal  0.399735 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08230  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 827 aa  1664    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1772  DNA topoisomerase IV subunit A  59.26 
 
 		 820 aa  905    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1693  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  57.48 
 
 		 826 aa  822    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0385634  normal  0.564105 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13190  DNA topoisomerase IV subunit A  52.66 
 
 		 868 aa  784    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1675  DNA topoisomerase IV subunit A  80.19 
 
 		 827 aa  1293    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.898685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1618  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  58.56 
 
 		 833 aa  868    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7080  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  57.93 
 
 		 831 aa  847    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  55.31 
 
 		 828 aa  850    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.121142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0699  DNA gyrase/topoisomerase IV, A subunit  47.14 
 
 		 887 aa  701    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1627  DNA topoisomerase IV subunit A  53.3 
 
 		 832 aa  810    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2281  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  81.38 
 
 		 1143 aa  1207    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1422  DNA topoisomerase IV subunit A  55.38 
 
 		 813 aa  817    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15900  DNA topoisomerase IV subunit A  58.46 
 
 		 823 aa  860    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0201184  normal  0.219646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2949  DNA topoisomerase IV subunit A  56.31 
 
 		 826 aa  820    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0430579  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0303  DNA topoisomerase IV subunit A  47.42 
 
 		 909 aa  758    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.821853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1934  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.89 
 
 		 855 aa  787    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.621213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  41.72 
 
 		 848 aa  551  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  42.03 
 
 		 889 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  42.03 
 
 		 889 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  41.5 
 
 		 893 aa  545  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  41.91 
 
 		 820 aa  545  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  41.55 
 
 		 834 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  41.35 
 
 		 818 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  42.22 
 
 		 875 aa  542  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  40.9 
 
 		 825 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  41.71 
 
 		 834 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  43.46 
 
 		 796 aa  536  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  41.2 
 
 		 837 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  40.92 
 
 		 807 aa  535  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  42.32 
 
 		 932 aa  535  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  40.44 
 
 		 821 aa  534  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  40.44 
 
 		 823 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  40.44 
 
 		 823 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  40.44 
 
 		 823 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  40.44 
 
 		 823 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  40.44 
 
 		 823 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 841 aa  529  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  40.44 
 
 		 823 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  40.44 
 
 		 823 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  40.31 
 
 		 823 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  40.44 
 
 		 823 aa  531  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  40.57 
 
 		 823 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  40.88 
 
 		 818 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  39.59 
 
 		 828 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  40.91 
 
 		 839 aa  528  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  39.13 
 
 		 853 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  42.71 
 
 		 824 aa  529  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  39.42 
 
 		 808 aa  523  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  40.45 
 
 		 870 aa  525  1e-147  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  40.79 
 
 		 839 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  39.66 
 
 		 807 aa  525  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  41.32 
 
 		 835 aa  521  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  41.77 
 
 		 814 aa  519  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  39.43 
 
 		 839 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  40.83 
 
 		 834 aa  520  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0007  DNA gyrase, A subunit  40.15 
 
 		 870 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0197472 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  39.49 
 
 		 901 aa  517  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  41.22 
 
 		 855 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  39.43 
 
 		 839 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  40.34 
 
 		 848 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  38.73 
 
 		 827 aa  514  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  39.19 
 
 		 863 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  40.47 
 
 		 848 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1431  DNA gyrase subunit A  39.62 
 
 		 883 aa  515  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0040  DNA gyrase, A subunit  40.08 
 
 		 876 aa  513  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  40.61 
 
 		 832 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  42.48 
 
 		 802 aa  515  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  40.59 
 
 		 838 aa  515  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0007  DNA gyrase, A subunit  40.92 
 
 		 839 aa  515  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4371  DNA gyrase subunit A  41.63 
 
 		 915 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289021  normal  0.322943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  39.66 
 
 		 827 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  37.96 
 
 		 863 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  40.16 
 
 		 809 aa  514  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  38.84 
 
 		 809 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  41.78 
 
 		 812 aa  511  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  41.42 
 
 		 811 aa  512  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0011  DNA gyrase, A subunit  42.14 
 
 		 822 aa  511  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81481  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  38.47 
 
 		 865 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  39.41 
 
 		 864 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0008  DNA gyrase subunit A  40.15 
 
 		 831 aa  511  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  40.24 
 
 		 836 aa  511  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  40.49 
 
 		 831 aa  512  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  37.67 
 
 		 865 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  40.5 
 
 		 949 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  39.76 
 
 		 836 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  38.88 
 
 		 857 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  40.25 
 
 		 856 aa  509  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  41.29 
 
 		 830 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0007  DNA gyrase subunit A  38.62 
 
 		 836 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0674911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  41.05 
 
 		 852 aa  508  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  38.88 
 
 		 857 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>