More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0008 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02157  DNA gyrase subunit A  45.56 
 
 		 875 aa  726    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1428  DNA gyrase, A subunit  45.56 
 
 		 875 aa  726    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000222135  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  44.34 
 
 		 833 aa  689    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  47.6 
 
 		 809 aa  741    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  49.28 
 
 		 857 aa  776    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  43.86 
 
 		 923 aa  701    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  44.17 
 
 		 859 aa  689    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  46.88 
 
 		 815 aa  755    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  47.93 
 
 		 893 aa  760    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  47.36 
 
 		 860 aa  749    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0901  DNA gyrase subunit A  46.5 
 
 		 885 aa  746    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.018045  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  49.63 
 
 		 823 aa  774    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2331  DNA gyrase, A subunit  44.68 
 
 		 908 aa  714    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.627723  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  49.44 
 
 		 819 aa  748    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2411  DNA gyrase, A subunit  44.52 
 
 		 919 aa  716    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1745  DNA gyrase, subunit A  44.06 
 
 		 928 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.6885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  49.63 
 
 		 823 aa  774    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  49.63 
 
 		 823 aa  774    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  49.32 
 
 		 823 aa  769    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0435  DNA gyrase subunit A  45.86 
 
 		 866 aa  732    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361933  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1372  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  47.98 
 
 		 863 aa  769    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1368  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  48.16 
 
 		 863 aa  766    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3647  DNA gyrase subunit A  44.06 
 
 		 925 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1543  DNA gyrase subunit A  43.51 
 
 		 930 aa  685    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.255758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1230  DNA gyrase subunit A  46.74 
 
 		 879 aa  747    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0017603  normal  0.486018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  69.34 
 
 		 848 aa  1149    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  46 
 
 		 883 aa  736    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  49.31 
 
 		 949 aa  765    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0948  DNA gyrase subunit A  47.09 
 
 		 849 aa  745    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  44.65 
 
 		 872 aa  713    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3000  DNA gyrase subunit A  45.86 
 
 		 866 aa  733    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0171  DNA gyrase, subunit A  46.32 
 
 		 846 aa  733    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4078  DNA gyrase subunit A  45.88 
 
 		 887 aa  708    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0373422  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  48.51 
 
 		 835 aa  758    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4153  DNA gyrase subunit A  46.45 
 
 		 867 aa  740    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  50.25 
 
 		 815 aa  766    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  49.38 
 
 		 828 aa  773    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  48.7 
 
 		 857 aa  770    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  45.08 
 
 		 811 aa  712    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  45.63 
 
 		 871 aa  736    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  49.63 
 
 		 823 aa  774    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  46.11 
 
 		 856 aa  712    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2189  DNA gyrase subunit A  47.49 
 
 		 893 aa  756    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  50.31 
 
 		 814 aa  790    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1632  DNA gyrase subunit A  45.74 
 
 		 866 aa  731    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4346  DNA gyrase subunit A  46.9 
 
 		 907 aa  718    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  70.68 
 
 		 834 aa  1159    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  45.02 
 
 		 839 aa  712    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1571  DNA gyrase subunit A  46.2 
 
 		 880 aa  712    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612234  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2148  DNA gyrase subunit A  45.04 
 
 		 886 aa  709    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0598325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  47.36 
 
 		 864 aa  754    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1795  DNA gyrase subunit A  45.95 
 
 		 880 aa  722    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979791  unclonable  0.00000642236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  46.69 
 
 		 882 aa  738    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1948  DNA gyrase, A subunit  45.6 
 
 		 908 aa  723    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000559672  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  48.82 
 
 		 830 aa  783    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  45.22 
 
 		 907 aa  728    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1724  DNA gyrase, A subunit  44.18 
 
 		 928 aa  691    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0733273  normal  0.707795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0713  DNA gyrase subunit A  45.8 
 
 		 897 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0387  DNA gyrase, A subunit  43.18 
 
 		 847 aa  694    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  44.98 
 
 		 865 aa  719    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  46.88 
 
 		 809 aa  723    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0561  DNA gyrase subunit A  46.57 
 
 		 867 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3573  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0007  DNA gyrase subunit A  75.75 
 
 		 1257 aa  1058    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  50.12 
 
 		 852 aa  766    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2470  DNA gyrase, A subunit  44.9 
 
 		 897 aa  733    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1400  DNA gyrase subunit A  42.98 
 
 		 929 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  46.91 
 
 		 865 aa  753    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  50.06 
 
 		 839 aa  806    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  50.19 
 
 		 839 aa  806    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1163  DNA gyrase subunit A  44.53 
 
 		 881 aa  732    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00841835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  44.9 
 
 		 885 aa  693    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1919  DNA gyrase subunit A  44.76 
 
 		 946 aa  720    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000233211  hitchhiker  0.00000000296006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2059  DNA gyrase subunit A  44.76 
 
 		 944 aa  720    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00127013  unclonable  0.0000452472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  46.64 
 
 		 862 aa  738    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2130  DNA gyrase, A subunit  45.49 
 
 		 909 aa  712    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.717755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  46.94 
 
 		 812 aa  751    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0916  DNA gyrase subunit A  46.45 
 
 		 867 aa  736    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23260  DNA gyrase subunit A  43.77 
 
 		 921 aa  699    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  50 
 
 		 836 aa  745    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  47.61 
 
 		 866 aa  725    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  47.27 
 
 		 829 aa  755    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  49.38 
 
 		 848 aa  742    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  50.12 
 
 		 817 aa  752    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0007  DNA gyrase subunit A  64.93 
 
 		 902 aa  1050    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1040  DNA gyrase subunit A  46.57 
 
 		 867 aa  740    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  51.75 
 
 		 796 aa  773    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  49.06 
 
 		 813 aa  780    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1072  DNA gyrase subunit A  46.22 
 
 		 915 aa  729    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1972  DNA gyrase subunit A  44.76 
 
 		 918 aa  720    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000455042  hitchhiker  0.000000817353 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  70.74 
 
 		 834 aa  1157    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  49.1 
 
 		 843 aa  772    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  49.22 
 
 		 827 aa  785    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0007  DNA gyrase subunit A  61.78 
 
 		 922 aa  1033    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1731  DNA gyrase subunit A  44.87 
 
 		 901 aa  721    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0884555  hitchhiker  0.00443229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0015  DNA gyrase subunit A  75.75 
 
 		 1257 aa  1058    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336793  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1114  DNA gyrase, A subunit  42.96 
 
 		 898 aa  702    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.37334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0007  DNA gyrase, A subunit  75.32 
 
 		 1262 aa  1055    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641743 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1021  DNA gyrase, A subunit  46.48 
 
 		 856 aa  741    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0962038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  43.8 
 
 		 856 aa  689    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3280  DNA gyrase subunit A  46.16 
 
 		 886 aa  722    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.586239  normal  0.260066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>