More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1422 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1681  DNA topoisomerase IV subunit A  54.23 
 
 		 827 aa  768    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.638406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14430  DNA topoisomerase IV subunit A  61.04 
 
 		 822 aa  924    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0776832  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  58.91 
 
 		 828 aa  918    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.121142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1546  DNA topoisomerase IV subunit A  60.61 
 
 		 826 aa  875    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0628876  normal  0.0572906 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0699  DNA gyrase/topoisomerase IV, A subunit  48.45 
 
 		 887 aa  733    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  62.79 
 
 		 831 aa  1000    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16040  DNA topoisomerase IV subunit A  61.85 
 
 		 824 aa  935    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1675  DNA topoisomerase IV subunit A  54.35 
 
 		 827 aa  763    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.898685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1621  DNA topoisomerase IV subunit A  58.7 
 
 		 836 aa  924    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000739384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1618  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  65.65 
 
 		 833 aa  999    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7080  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  61.99 
 
 		 831 aa  965    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1693  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  62.73 
 
 		 826 aa  928    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0385634  normal  0.564105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2387  DNA topoisomerase  64.81 
 
 		 841 aa  988    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0699814  normal  0.399735 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0303  DNA topoisomerase IV subunit A  49.55 
 
 		 909 aa  793    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.821853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1928  DNA topoisomerase IV subunit A  62.52 
 
 		 819 aa  905    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.769322  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1934  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  56.99 
 
 		 855 aa  887    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.621213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08230  DNA topoisomerase IV subunit A  55.38 
 
 		 827 aa  806    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  60.32 
 
 		 828 aa  957    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1772  DNA topoisomerase IV subunit A  59.46 
 
 		 820 aa  939    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1627  DNA topoisomerase IV subunit A  57.57 
 
 		 832 aa  907    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1422  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 813 aa  1611    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2949  DNA topoisomerase IV subunit A  59.61 
 
 		 826 aa  894    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0430579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2281  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.08 
 
 		 1143 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13190  DNA topoisomerase IV subunit A  56.15 
 
 		 868 aa  830    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165403  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15900  DNA topoisomerase IV subunit A  60.44 
 
 		 823 aa  902    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0201184  normal  0.219646 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  41.18 
 
 		 814 aa  586  1e-166  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  43.41 
 
 		 802 aa  585  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  43.06 
 
 		 812 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  42.23 
 
 		 901 aa  571  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  41.93 
 
 		 818 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  42.54 
 
 		 820 aa  568  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  40.79 
 
 		 825 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  43.77 
 
 		 824 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  43.68 
 
 		 796 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  42.4 
 
 		 836 aa  559  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  41.74 
 
 		 893 aa  558  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  42.54 
 
 		 834 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  40.11 
 
 		 828 aa  557  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0006  DNA gyrase, A subunit  45.5 
 
 		 816 aa  554  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0007  DNA gyrase, A subunit  43.86 
 
 		 870 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0197472 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  40.5 
 
 		 839 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  44.36 
 
 		 834 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  42.66 
 
 		 848 aa  551  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  40.42 
 
 		 809 aa  551  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  40.5 
 
 		 839 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  38.97 
 
 		 823 aa  550  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  43.14 
 
 		 823 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  41.18 
 
 		 841 aa  545  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  42.86 
 
 		 875 aa  546  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  38.71 
 
 		 823 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  40.12 
 
 		 889 aa  548  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  41.36 
 
 		 830 aa  546  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  40.12 
 
 		 889 aa  548  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  38.84 
 
 		 823 aa  548  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  38.59 
 
 		 823 aa  545  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  38.59 
 
 		 823 aa  545  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  38.59 
 
 		 823 aa  545  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  38.59 
 
 		 823 aa  545  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  38.4 
 
 		 821 aa  544  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  40.03 
 
 		 853 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  38.59 
 
 		 823 aa  545  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2151  DNA gyrase, A subunit  39.41 
 
 		 834 aa  545  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  38.59 
 
 		 823 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  38.59 
 
 		 823 aa  545  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  40.21 
 
 		 818 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  39.63 
 
 		 807 aa  542  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  39.12 
 
 		 808 aa  544  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  42.61 
 
 		 823 aa  545  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  42.65 
 
 		 837 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  39.72 
 
 		 815 aa  541  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  41.96 
 
 		 827 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  39.08 
 
 		 827 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  41.01 
 
 		 806 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  42.9 
 
 		 814 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  43.31 
 
 		 834 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  39.92 
 
 		 839 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  42.13 
 
 		 839 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  42.25 
 
 		 811 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  39.65 
 
 		 817 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  42.8 
 
 		 839 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  40.67 
 
 		 848 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  41.8 
 
 		 860 aa  536  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  39.87 
 
 		 899 aa  536  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  41.22 
 
 		 809 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  42.69 
 
 		 831 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  39.51 
 
 		 870 aa  538  1e-151  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0007  DNA gyrase, A subunit  43.3 
 
 		 856 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  42.69 
 
 		 816 aa  537  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  41.77 
 
 		 865 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  40.82 
 
 		 809 aa  533  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  40.23 
 
 		 857 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0007  DNA gyrase, A subunit  43.11 
 
 		 870 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  40.23 
 
 		 857 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  40.74 
 
 		 932 aa  532  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  39.63 
 
 		 848 aa  534  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0007  DNA gyrase subunit A  41.5 
 
 		 840 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  38.49 
 
 		 807 aa  535  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  42.19 
 
 		 865 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  41.41 
 
 		 863 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  41.24 
 
 		 875 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>