More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2949 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  62.39 
 
 		 828 aa  999    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14430  DNA topoisomerase IV subunit A  59.68 
 
 		 822 aa  948    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0776832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  61.99 
 
 		 831 aa  1010    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1546  DNA topoisomerase IV subunit A  62.3 
 
 		 826 aa  959    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0628876  normal  0.0572906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2387  DNA topoisomerase  64.02 
 
 		 841 aa  1008    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0699814  normal  0.399735 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15900  DNA topoisomerase IV subunit A  63.52 
 
 		 823 aa  1000    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0201184  normal  0.219646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1618  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  66.63 
 
 		 833 aa  1047    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7080  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  65.53 
 
 		 831 aa  1042    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1928  DNA topoisomerase IV subunit A  61.61 
 
 		 819 aa  947    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.769322  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2281  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  56.43 
 
 		 1143 aa  746    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1693  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  65.18 
 
 		 826 aa  999    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0385634  normal  0.564105 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13190  DNA topoisomerase IV subunit A  57.9 
 
 		 868 aa  888    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165403  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1621  DNA topoisomerase IV subunit A  60.89 
 
 		 836 aa  1011    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000739384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1627  DNA topoisomerase IV subunit A  60.05 
 
 		 832 aa  983    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1772  DNA topoisomerase IV subunit A  62.61 
 
 		 820 aa  1010    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1422  DNA topoisomerase IV subunit A  60.42 
 
 		 813 aa  930    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1934  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  59.21 
 
 		 855 aa  938    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.621213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2949  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 826 aa  1658    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0430579  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0303  DNA topoisomerase IV subunit A  51.44 
 
 		 909 aa  845    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.821853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1681  DNA topoisomerase IV subunit A  54.14 
 
 		 827 aa  788    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.638406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  58.1 
 
 		 828 aa  946    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.121142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16040  DNA topoisomerase IV subunit A  64.11 
 
 		 824 aa  1040    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08230  DNA topoisomerase IV subunit A  56.67 
 
 		 827 aa  834    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1675  DNA topoisomerase IV subunit A  54.99 
 
 		 827 aa  793    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.898685 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0699  DNA gyrase/topoisomerase IV, A subunit  49.88 
 
 		 887 aa  769    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  43.69 
 
 		 824 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  42.41 
 
 		 837 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  44.17 
 
 		 823 aa  572  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  43.77 
 
 		 823 aa  568  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  40.43 
 
 		 841 aa  562  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  41.5 
 
 		 834 aa  556  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  41.29 
 
 		 834 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  41.82 
 
 		 818 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  40.95 
 
 		 825 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0007  DNA gyrase subunit A  40.66 
 
 		 836 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0674911 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  41.32 
 
 		 839 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  41 
 
 		 820 aa  551  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  39.9 
 
 		 828 aa  551  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  41.18 
 
 		 839 aa  547  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10006  DNA gyrase subunit A  41.15 
 
 		 838 aa  548  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  41.27 
 
 		 839 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  42.1 
 
 		 901 aa  546  1e-154  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  41.4 
 
 		 839 aa  548  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  40.37 
 
 		 818 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  40.7 
 
 		 848 aa  545  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  40.16 
 
 		 870 aa  543  1e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  42.56 
 
 		 812 aa  545  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0011  DNA gyrase, A subunit  43.31 
 
 		 822 aa  543  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81481  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0007  DNA gyrase, A subunit  40.88 
 
 		 870 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0197472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  42.17 
 
 		 852 aa  542  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  39.37 
 
 		 807 aa  544  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  42.12 
 
 		 802 aa  544  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  38.69 
 
 		 823 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  40.42 
 
 		 893 aa  542  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  38.81 
 
 		 823 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  41.12 
 
 		 932 aa  541  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  38.57 
 
 		 823 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  41.21 
 
 		 830 aa  542  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  39.54 
 
 		 899 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  39.27 
 
 		 809 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  41.31 
 
 		 806 aa  538  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  38.44 
 
 		 823 aa  537  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  38.44 
 
 		 823 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  38.44 
 
 		 823 aa  537  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0007  DNA gyrase, A subunit  41.36 
 
 		 839 aa  538  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0010  DNA gyrase, A subunit  40.42 
 
 		 837 aa  538  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  38.44 
 
 		 823 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  38.44 
 
 		 823 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  38.44 
 
 		 823 aa  538  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  41.1 
 
 		 831 aa  539  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1431  DNA gyrase subunit A  39.54 
 
 		 883 aa  538  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  40.84 
 
 		 848 aa  537  1e-151  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  38.32 
 
 		 823 aa  535  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  41.12 
 
 		 809 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0008  DNA gyrase subunit A  41.09 
 
 		 831 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  41.08 
 
 		 866 aa  535  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  38.2 
 
 		 821 aa  532  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  40.57 
 
 		 834 aa  535  1e-150  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  38.94 
 
 		 827 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  38.25 
 
 		 889 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  40.71 
 
 		 875 aa  531  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  38.66 
 
 		 814 aa  532  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0007  DNA gyrase subunit A  42.2 
 
 		 875 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876673  normal  0.542792 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  38.73 
 
 		 856 aa  529  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  38.85 
 
 		 875 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  41.5 
 
 		 827 aa  531  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  38.25 
 
 		 889 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2474  DNA gyrase, A subunit  41.56 
 
 		 805 aa  531  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000172995  decreased coverage  0.00702489 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  40.6 
 
 		 836 aa  532  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0040  DNA gyrase, A subunit  40.71 
 
 		 876 aa  531  1e-149  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  41.91 
 
 		 796 aa  530  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  41.16 
 
 		 834 aa  530  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00070  DNA gyrase subunit A  40.91 
 
 		 883 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  40 
 
 		 853 aa  527  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  40.13 
 
 		 865 aa  528  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0008  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  40.97 
 
 		 836 aa  529  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  40.47 
 
 		 808 aa  525  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2163  DNA gyrase, A subunit  37.82 
 
 		 869 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.612528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0007  DNA gyrase subunit A  39.37 
 
 		 840 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277019  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  40.96 
 
 		 838 aa  524  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>