More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14430 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  60.77 
 
 		 828 aa  996    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.121142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2281  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.6 
 
 		 1143 aa  705    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  60.9 
 
 		 831 aa  962    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1621  DNA topoisomerase IV subunit A  63.22 
 
 		 836 aa  1042    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000739384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1693  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  64.15 
 
 		 826 aa  978    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0385634  normal  0.564105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1772  DNA topoisomerase IV subunit A  59.3 
 
 		 820 aa  931    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13190  DNA topoisomerase IV subunit A  58.23 
 
 		 868 aa  915    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1546  DNA topoisomerase IV subunit A  62.61 
 
 		 826 aa  939    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0628876  normal  0.0572906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1928  DNA topoisomerase IV subunit A  65.26 
 
 		 819 aa  985    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.769322  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08230  DNA topoisomerase IV subunit A  55.69 
 
 		 827 aa  820    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0699  DNA gyrase/topoisomerase IV, A subunit  49.5 
 
 		 887 aa  778    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1618  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  63.33 
 
 		 833 aa  977    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485256  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16040  DNA topoisomerase IV subunit A  64.39 
 
 		 824 aa  1036    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2387  DNA topoisomerase  64.35 
 
 		 841 aa  998    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0699814  normal  0.399735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7080  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  62 
 
 		 831 aa  976    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0303  DNA topoisomerase IV subunit A  51.51 
 
 		 909 aa  844    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.821853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  59.83 
 
 		 828 aa  928    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1681  DNA topoisomerase IV subunit A  51.97 
 
 		 827 aa  752    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.638406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1934  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  60.9 
 
 		 855 aa  978    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.621213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1627  DNA topoisomerase IV subunit A  63.53 
 
 		 832 aa  1015    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1422  DNA topoisomerase IV subunit A  61.04 
 
 		 813 aa  934    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14430  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 822 aa  1635    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0776832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2949  DNA topoisomerase IV subunit A  59.81 
 
 		 826 aa  934    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0430579  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15900  DNA topoisomerase IV subunit A  66.01 
 
 		 823 aa  1021    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0201184  normal  0.219646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1675  DNA topoisomerase IV subunit A  52.15 
 
 		 827 aa  749    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.898685 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  42.08 
 
 		 901 aa  560  1e-158  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  43.8 
 
 		 824 aa  556  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  39.97 
 
 		 839 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  44.18 
 
 		 812 aa  547  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  39.97 
 
 		 839 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  40.88 
 
 		 820 aa  540  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  39.56 
 
 		 828 aa  538  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  41.59 
 
 		 834 aa  535  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0008  DNA gyrase subunit A  41.52 
 
 		 831 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  40.71 
 
 		 818 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0006  DNA gyrase, A subunit  45.24 
 
 		 816 aa  538  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  41.16 
 
 		 837 aa  534  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  40.8 
 
 		 809 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  41.27 
 
 		 834 aa  534  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  40.83 
 
 		 841 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  40.13 
 
 		 814 aa  534  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  41.89 
 
 		 932 aa  533  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  42.2 
 
 		 823 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  41.08 
 
 		 893 aa  531  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  39.15 
 
 		 807 aa  532  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  40.85 
 
 		 875 aa  531  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0007  DNA gyrase, A subunit  40.98 
 
 		 870 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0197472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  41.79 
 
 		 852 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  40.36 
 
 		 870 aa  531  1e-149  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  41.88 
 
 		 823 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  42.54 
 
 		 811 aa  527  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  42.15 
 
 		 796 aa  527  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  42.21 
 
 		 802 aa  526  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  41.13 
 
 		 848 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  42.03 
 
 		 838 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  40.9 
 
 		 889 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  40.9 
 
 		 889 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  40.36 
 
 		 816 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0007  DNA gyrase subunit A  41.05 
 
 		 836 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0674911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  39.52 
 
 		 808 aa  521  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  40.75 
 
 		 831 aa  520  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  41.22 
 
 		 809 aa  522  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1431  DNA gyrase subunit A  39.77 
 
 		 883 aa  520  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  39.04 
 
 		 796 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2730  DNA gyrase, A subunit  41.59 
 
 		 819 aa  521  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  42.13 
 
 		 806 aa  521  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  41.69 
 
 		 827 aa  518  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  41.5 
 
 		 814 aa  518  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11138  DNA gyrase A subunit  41.16 
 
 		 848 aa  516  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185535  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0040  DNA gyrase, A subunit  40.25 
 
 		 876 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  41.69 
 
 		 816 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  41.01 
 
 		 839 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  39.03 
 
 		 821 aa  512  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  40.73 
 
 		 839 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  39.97 
 
 		 848 aa  515  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  39.77 
 
 		 817 aa  515  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  38.93 
 
 		 899 aa  515  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  40.89 
 
 		 818 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  37.98 
 
 		 827 aa  515  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1049  DNA gyrase, A subunit  41.58 
 
 		 838 aa  512  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385966  normal  0.255523 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  38.95 
 
 		 819 aa  511  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  39.35 
 
 		 825 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  40.29 
 
 		 811 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  40.85 
 
 		 834 aa  512  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  40.1 
 
 		 827 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  39.91 
 
 		 875 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0007  DNA gyrase subunit A  39.8 
 
 		 840 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277019  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  43.26 
 
 		 828 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  39.41 
 
 		 809 aa  508  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00070  DNA gyrase subunit A  40.28 
 
 		 883 aa  508  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  39.03 
 
 		 836 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  37.4 
 
 		 840 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  39.81 
 
 		 838 aa  506  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  39.15 
 
 		 809 aa  504  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  38.9 
 
 		 823 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  38.9 
 
 		 823 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  38.9 
 
 		 823 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  38.9 
 
 		 823 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  42.16 
 
 		 827 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  38.9 
 
 		 823 aa  504  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>