More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1934 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1675  DNA topoisomerase IV subunit A  52.68 
 
 		 827 aa  756    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.898685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2387  DNA topoisomerase  60.71 
 
 		 841 aa  947    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0699814  normal  0.399735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1928  DNA topoisomerase IV subunit A  67.72 
 
 		 819 aa  1067    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.769322  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08230  DNA topoisomerase IV subunit A  54.36 
 
 		 827 aa  797    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7080  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  61.03 
 
 		 831 aa  973    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2281  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.88 
 
 		 1143 aa  731    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  58.3 
 
 		 831 aa  944    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1618  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  61.31 
 
 		 833 aa  956    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485256  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  57.63 
 
 		 828 aa  922    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1693  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  69.65 
 
 		 826 aa  1119    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0385634  normal  0.564105 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16040  DNA topoisomerase IV subunit A  69 
 
 		 824 aa  1165    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14430  DNA topoisomerase IV subunit A  61.11 
 
 		 822 aa  982    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0776832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15900  DNA topoisomerase IV subunit A  62.8 
 
 		 823 aa  990    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0201184  normal  0.219646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1546  DNA topoisomerase IV subunit A  60.37 
 
 		 826 aa  907    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0628876  normal  0.0572906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1621  DNA topoisomerase IV subunit A  60.72 
 
 		 836 aa  1039    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000739384 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0699  DNA gyrase/topoisomerase IV, A subunit  52.21 
 
 		 887 aa  838    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1772  DNA topoisomerase IV subunit A  56.48 
 
 		 820 aa  910    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1934  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 855 aa  1681    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.621213  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1681  DNA topoisomerase IV subunit A  52.68 
 
 		 827 aa  759    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.638406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1627  DNA topoisomerase IV subunit A  60.86 
 
 		 832 aa  1023    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1435  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  63.24 
 
 		 828 aa  1045    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.121142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1422  DNA topoisomerase IV subunit A  57.11 
 
 		 813 aa  895    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0303  DNA topoisomerase IV subunit A  53.33 
 
 		 909 aa  902    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.821853  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13190  DNA topoisomerase IV subunit A  58 
 
 		 868 aa  918    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2949  DNA topoisomerase IV subunit A  59.91 
 
 		 826 aa  931    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0430579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  38.21 
 
 		 809 aa  555  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  40.98 
 
 		 901 aa  540  9.999999999999999e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  40.55 
 
 		 824 aa  540  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  37.65 
 
 		 893 aa  537  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  40.55 
 
 		 823 aa  536  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  41.15 
 
 		 839 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0007  DNA gyrase subunit A  39.56 
 
 		 836 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0674911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  39.88 
 
 		 841 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  41.11 
 
 		 831 aa  534  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  38.76 
 
 		 852 aa  534  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  40.9 
 
 		 839 aa  535  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  37.04 
 
 		 828 aa  532  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  40.46 
 
 		 837 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  40.44 
 
 		 834 aa  532  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  37.65 
 
 		 839 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  37.65 
 
 		 839 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  39.85 
 
 		 802 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  38.71 
 
 		 834 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  40.79 
 
 		 816 aa  528  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  38.69 
 
 		 807 aa  528  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  40.15 
 
 		 823 aa  528  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  37.44 
 
 		 814 aa  527  1e-148  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  42.2 
 
 		 812 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0007  DNA gyrase, A subunit  40.1 
 
 		 870 aa  525  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0197472 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  37.77 
 
 		 889 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  38.57 
 
 		 820 aa  523  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0010  DNA gyrase, A subunit  39.63 
 
 		 837 aa  525  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  37.77 
 
 		 889 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  40.5 
 
 		 875 aa  521  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  40.03 
 
 		 865 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10006  DNA gyrase subunit A  38.76 
 
 		 838 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  39.04 
 
 		 899 aa  519  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0007  DNA gyrase subunit A  38.32 
 
 		 840 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  37.75 
 
 		 818 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  38.44 
 
 		 856 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  38.78 
 
 		 814 aa  518  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00070  DNA gyrase subunit A  40.46 
 
 		 883 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  40.08 
 
 		 796 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  38.26 
 
 		 808 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  39.56 
 
 		 848 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  38.16 
 
 		 870 aa  514  1e-144  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  39.32 
 
 		 827 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  37.31 
 
 		 807 aa  515  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0008  DNA gyrase subunit A  40.3 
 
 		 831 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0441  DNA gyrase, A subunit  36.75 
 
 		 810 aa  511  1e-143  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.624683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  37.13 
 
 		 825 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0007  DNA gyrase, A subunit  41.69 
 
 		 870 aa  511  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  37.44 
 
 		 853 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  37.04 
 
 		 812 aa  509  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0011  DNA gyrase, A subunit  40.25 
 
 		 822 aa  510  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81481  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  38.11 
 
 		 932 aa  510  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  39.26 
 
 		 834 aa  511  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  38.57 
 
 		 838 aa  510  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  39.95 
 
 		 806 aa  508  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0007  DNA gyrase subunit A  39.41 
 
 		 902 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  37.32 
 
 		 809 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  39.32 
 
 		 864 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0007  DNA gyrase subunit A  39.77 
 
 		 876 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000011369 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  37.83 
 
 		 872 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  38.49 
 
 		 827 aa  505  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  39.18 
 
 		 838 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  39.85 
 
 		 883 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  37.78 
 
 		 809 aa  501  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  40.08 
 
 		 815 aa  501  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  39.04 
 
 		 913 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  38.81 
 
 		 828 aa  499  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  37.66 
 
 		 809 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  39.97 
 
 		 881 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  36.2 
 
 		 821 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  36.97 
 
 		 865 aa  502  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  37.71 
 
 		 872 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0040  DNA gyrase, A subunit  38.14 
 
 		 876 aa  502  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  39.14 
 
 		 855 aa  502  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  37.73 
 
 		 818 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  36.2 
 
 		 823 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>