More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2281 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1546  DNA topoisomerase IV subunit A  56.82 
 
 		 826 aa  730    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0628876  normal  0.0572906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15900  DNA topoisomerase IV subunit A  57.5 
 
 		 823 aa  770    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0201184  normal  0.219646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1681  DNA topoisomerase IV subunit A  76.78 
 
 		 827 aa  1107    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.638406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1621  DNA topoisomerase IV subunit A  55.01 
 
 		 836 aa  768    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000739384 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13190  DNA topoisomerase IV subunit A  52.69 
 
 		 868 aa  695    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1772  DNA topoisomerase IV subunit A  57.22 
 
 		 820 aa  812    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  56.68 
 
 		 831 aa  783    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1618  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  59.27 
 
 		 833 aa  791    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485256  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  52.72 
 
 		 828 aa  736    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.121142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7080  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  58.05 
 
 		 831 aa  767    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08230  DNA topoisomerase IV subunit A  81.38 
 
 		 827 aa  1207    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1928  DNA topoisomerase IV subunit A  56.85 
 
 		 819 aa  733    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.769322  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0303  DNA topoisomerase IV subunit A  46.16 
 
 		 909 aa  660    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.821853  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16040  DNA topoisomerase IV subunit A  56.93 
 
 		 824 aa  754    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2281  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 1143 aa  2263    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1627  DNA topoisomerase IV subunit A  54.73 
 
 		 832 aa  741    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.18 
 
 		 828 aa  763    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1693  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  57.31 
 
 		 826 aa  746    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0385634  normal  0.564105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1422  DNA topoisomerase IV subunit A  54.08 
 
 		 813 aa  722    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2949  DNA topoisomerase IV subunit A  55.9 
 
 		 826 aa  730    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0430579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2387  DNA topoisomerase  58.62 
 
 		 841 aa  786    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0699814  normal  0.399735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14430  DNA topoisomerase IV subunit A  52.46 
 
 		 822 aa  697    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0776832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1934  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.37 
 
 		 855 aa  720    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.621213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1675  DNA topoisomerase IV subunit A  77.58 
 
 		 827 aa  1093    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.898685 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0699  DNA gyrase/topoisomerase IV, A subunit  46.67 
 
 		 887 aa  611  1e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  39.48 
 
 		 823 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  39.03 
 
 		 823 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  39.03 
 
 		 823 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  39.03 
 
 		 823 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  39.03 
 
 		 823 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  39.48 
 
 		 823 aa  466  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  39.21 
 
 		 823 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  39.07 
 
 		 823 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  39.03 
 
 		 823 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  39.03 
 
 		 823 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  40.54 
 
 		 820 aa  460  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  38.88 
 
 		 818 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  38.34 
 
 		 825 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  37.91 
 
 		 821 aa  456  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  39.31 
 
 		 889 aa  452  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  39.31 
 
 		 889 aa  452  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  38.59 
 
 		 893 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  39.42 
 
 		 901 aa  444  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  37.97 
 
 		 818 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  39.06 
 
 		 834 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  36.01 
 
 		 828 aa  446  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  38.05 
 
 		 834 aa  443  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  36.8 
 
 		 807 aa  445  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  38.01 
 
 		 870 aa  444  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  39.51 
 
 		 949 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  39.71 
 
 		 824 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  37.75 
 
 		 839 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  37.75 
 
 		 839 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  37.23 
 
 		 839 aa  442  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  38.77 
 
 		 848 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  37.4 
 
 		 839 aa  439  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  37.89 
 
 		 839 aa  436  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  38.54 
 
 		 812 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  37.66 
 
 		 807 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  40.17 
 
 		 796 aa  437  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  37.99 
 
 		 837 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  38.25 
 
 		 827 aa  439  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  37.12 
 
 		 834 aa  435  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  39.05 
 
 		 811 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  38.44 
 
 		 932 aa  434  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  37.88 
 
 		 841 aa  435  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  39.46 
 
 		 875 aa  435  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  37.54 
 
 		 809 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  36.78 
 
 		 808 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  40.14 
 
 		 802 aa  432  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  39.37 
 
 		 835 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  36.57 
 
 		 814 aa  432  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  38.36 
 
 		 814 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  38.36 
 
 		 848 aa  431  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0007  DNA gyrase, A subunit  38.08 
 
 		 870 aa  432  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0197472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  38.61 
 
 		 812 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  36.99 
 
 		 853 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  38.21 
 
 		 855 aa  429  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0010  DNA gyrase, A subunit  37.01 
 
 		 837 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  36.3 
 
 		 816 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  37.24 
 
 		 830 aa  424  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  36.84 
 
 		 838 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  37.43 
 
 		 836 aa  426  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0007  DNA gyrase, A subunit  40.3 
 
 		 870 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  37.08 
 
 		 836 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00070  DNA gyrase subunit A  38.58 
 
 		 883 aa  425  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  38.37 
 
 		 816 aa  424  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  36.79 
 
 		 875 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  37.39 
 
 		 819 aa  420  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0007  DNA gyrase subunit A  37.67 
 
 		 875 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876673  normal  0.542792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  38.13 
 
 		 883 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  37.23 
 
 		 856 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  37.45 
 
 		 838 aa  423  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  37.08 
 
 		 836 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  38.1 
 
 		 852 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0305  DNA gyrase, A subunit  38.27 
 
 		 846 aa  421  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  37.64 
 
 		 819 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0007  DNA gyrase, A subunit  38.32 
 
 		 839 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  37.38 
 
 		 853 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  36.45 
 
 		 809 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>