More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1618 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1546  DNA topoisomerase IV subunit A  64.05 
 
 
826 aa  949    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0628876  normal  0.0572906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7080  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  75.3 
 
 
831 aa  1221    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0699  DNA gyrase/topoisomerase IV, A subunit  51.93 
 
 
887 aa  806    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  70.83 
 
 
831 aa  1152    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1681  DNA topoisomerase IV subunit A  57.65 
 
 
827 aa  831    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.638406  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15900  DNA topoisomerase IV subunit A  65.36 
 
 
823 aa  1014    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0201184  normal  0.219646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1675  DNA topoisomerase IV subunit A  57.77 
 
 
827 aa  822    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.898685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16040  DNA topoisomerase IV subunit A  63.84 
 
 
824 aa  1010    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1772  DNA topoisomerase IV subunit A  67.12 
 
 
820 aa  1078    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2281  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  59.27 
 
 
1143 aa  785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  69.64 
 
 
828 aa  1107    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14430  DNA topoisomerase IV subunit A  62.61 
 
 
822 aa  976    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0776832  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2387  DNA topoisomerase  76.51 
 
 
841 aa  1193    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0699814  normal  0.399735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  61.06 
 
 
828 aa  992    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.121142  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1928  DNA topoisomerase IV subunit A  64.09 
 
 
819 aa  972    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.769322  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13190  DNA topoisomerase IV subunit A  57.23 
 
 
868 aa  889    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1627  DNA topoisomerase IV subunit A  63.18 
 
 
832 aa  1028    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1435  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0303  DNA topoisomerase IV subunit A  52.31 
 
 
909 aa  852    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.821853  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1422  DNA topoisomerase IV subunit A  65.53 
 
 
813 aa  1017    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2949  DNA topoisomerase IV subunit A  65.85 
 
 
826 aa  1016    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0430579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1618  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 
833 aa  1654    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485256  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08230  DNA topoisomerase IV subunit A  57.85 
 
 
827 aa  863    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1621  DNA topoisomerase IV subunit A  61.21 
 
 
836 aa  1017    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000739384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1934  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  60.56 
 
 
855 aa  948    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.621213  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1693  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  65.43 
 
 
826 aa  1002    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0385634  normal  0.564105 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  42.41 
 
 
901 aa  575  1.0000000000000001e-162  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  41.95 
 
 
839 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  43.73 
 
 
824 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  41.53 
 
 
893 aa  568  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  43.76 
 
 
823 aa  568  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  41.82 
 
 
839 aa  568  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  44.18 
 
 
802 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  40.77 
 
 
820 aa  565  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  41.39 
 
 
814 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  43.29 
 
 
823 aa  564  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  42.43 
 
 
837 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  40.1 
 
 
823 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  40.2 
 
 
821 aa  560  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  40.1 
 
 
823 aa  558  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  40.1 
 
 
823 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  40.1 
 
 
823 aa  558  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  40.1 
 
 
823 aa  558  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  41.62 
 
 
812 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  40.1 
 
 
823 aa  558  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  41.15 
 
 
889 aa  557  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  40.64 
 
 
841 aa  556  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  40.1 
 
 
823 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  41.22 
 
 
836 aa  557  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  40.1 
 
 
823 aa  558  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  41.15 
 
 
889 aa  557  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  39.98 
 
 
823 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  40.1 
 
 
823 aa  558  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  41.86 
 
 
834 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  43.22 
 
 
875 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  41.78 
 
 
932 aa  552  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  40.53 
 
 
825 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0007  DNA gyrase, A subunit  40.9 
 
 
870 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0197472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  41.38 
 
 
834 aa  547  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  41.09 
 
 
830 aa  548  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  40.19 
 
 
809 aa  548  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0006  DNA gyrase, A subunit  45.59 
 
 
816 aa  548  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  42.11 
 
 
807 aa  548  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  42.38 
 
 
806 aa  547  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  41.93 
 
 
848 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  40.31 
 
 
828 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  42.48 
 
 
839 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  40.23 
 
 
818 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0007  DNA gyrase subunit A  39.9 
 
 
836 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0674911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  42.16 
 
 
827 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  41.53 
 
 
848 aa  545  1e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  40.99 
 
 
834 aa  543  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  42.61 
 
 
839 aa  544  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  40.63 
 
 
819 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  40.05 
 
 
848 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  39.5 
 
 
818 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10006  DNA gyrase subunit A  40.44 
 
 
838 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  42.01 
 
 
796 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  41.87 
 
 
870 aa  539  9.999999999999999e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  40.89 
 
 
809 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  41.11 
 
 
809 aa  538  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  42.34 
 
 
816 aa  538  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  41.73 
 
 
809 aa  537  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2730  DNA gyrase, A subunit  40.12 
 
 
819 aa  536  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  44.11 
 
 
852 aa  536  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0010  DNA gyrase, A subunit  40.31 
 
 
837 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  40.7 
 
 
831 aa  534  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0008  DNA gyrase subunit A  41.66 
 
 
831 aa  534  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  42.05 
 
 
814 aa  532  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0007  DNA gyrase subunit A  42.2 
 
 
875 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876673  normal  0.542792 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  41.61 
 
 
875 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  39.5 
 
 
838 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  41.99 
 
 
853 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  40.91 
 
 
860 aa  531  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  41.08 
 
 
809 aa  531  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  38.89 
 
 
807 aa  530  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  43.51 
 
 
835 aa  531  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  42.04 
 
 
899 aa  529  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  42.03 
 
 
898 aa  532  1e-149  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  40.16 
 
 
817 aa  531  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0011  DNA gyrase, A subunit  42.61 
 
 
822 aa  531  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>