More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2645 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  47.95 
 
 		 898 aa  798    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  54.46 
 
 		 897 aa  895    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.25 
 
 		 697 aa  703    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  68.36 
 
 		 904 aa  1195    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  55.16 
 
 		 864 aa  873    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  60.07 
 
 		 832 aa  1058    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  56.65 
 
 		 906 aa  913    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  61.45 
 
 		 859 aa  1082    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  52.48 
 
 		 977 aa  938    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  57.74 
 
 		 846 aa  983    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 914 aa  1872    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.82 
 
 		 708 aa  691    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  45.69 
 
 		 703 aa  489  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  40.73 
 
 		 626 aa  445  1e-123  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  38.97 
 
 		 490 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  31.29 
 
 		 834 aa  203  9e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  37.32 
 
 		 934 aa  203  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  33.99 
 
 		 748 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  37.03 
 
 		 923 aa  202  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  33.77 
 
 		 748 aa  202  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  32.37 
 
 		 893 aa  201  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  31.42 
 
 		 928 aa  201  6e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  32.18 
 
 		 840 aa  200  9e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  37.03 
 
 		 922 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  30.21 
 
 		 848 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  34.06 
 
 		 748 aa  198  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  37.69 
 
 		 856 aa  198  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  30.31 
 
 		 818 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  32.17 
 
 		 889 aa  197  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  32.17 
 
 		 889 aa  197  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  32.16 
 
 		 855 aa  197  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  30.6 
 
 		 811 aa  197  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  32.37 
 
 		 812 aa  197  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  27.71 
 
 		 853 aa  195  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0493  DNA gyrase subunit A  33.62 
 
 		 900 aa  195  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  30.37 
 
 		 828 aa  195  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4719  DNA gyrase subunit A  33.06 
 
 		 888 aa  195  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.902316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  30.25 
 
 		 825 aa  195  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2024  DNA gyrase, A subunit  29.23 
 
 		 841 aa  194  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  25.84 
 
 		 839 aa  194  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  27.27 
 
 		 836 aa  194  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  34.29 
 
 		 809 aa  194  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  30.75 
 
 		 745 aa  194  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1848  DNA gyrase subunit A  29.51 
 
 		 922 aa  194  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409783  normal  0.837325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  32.3 
 
 		 748 aa  194  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3865  DNA gyrase subunit A  29.76 
 
 		 913 aa  194  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  34.11 
 
 		 927 aa  194  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1571  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 880 aa  193  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  33.19 
 
 		 748 aa  193  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  25.77 
 
 		 839 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1315  DNA gyrase subunit A  33.04 
 
 		 902 aa  192  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000857491  decreased coverage  3.4629599999999997e-25 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1255  DNA topoisomerase IV subunit A  33.11 
 
 		 751 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209338 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2630  DNA gyrase subunit A  34 
 
 		 907 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1620  DNA gyrase subunit A  33.43 
 
 		 881 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2790  DNA gyrase subunit A  34.2 
 
 		 889 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0140578  hitchhiker  0.00260367 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  32.52 
 
 		 848 aa  193  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1287  DNA gyrase subunit A  34 
 
 		 907 aa  193  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  36.53 
 
 		 796 aa  192  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  29.88 
 
 		 839 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  32.82 
 
 		 748 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  34.26 
 
 		 807 aa  192  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  31.3 
 
 		 758 aa  192  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1795  DNA gyrase subunit A  33.91 
 
 		 880 aa  191  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979791  unclonable  0.00000642236 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2151  DNA gyrase, A subunit  29.33 
 
 		 834 aa  191  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186517  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  28.67 
 
 		 796 aa  191  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  28.42 
 
 		 819 aa  191  5.999999999999999e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1744  DNA topoisomerase IV subunit A  31.11 
 
 		 759 aa  191  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  35.14 
 
 		 817 aa  191  7e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  34.23 
 
 		 923 aa  190  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  32.43 
 
 		 750 aa  191  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3947  DNA gyrase subunit A  34.23 
 
 		 919 aa  190  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00094025  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  32.42 
 
 		 904 aa  190  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1286  DNA gyrase, A subunit  35.44 
 
 		 873 aa  190  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  33.06 
 
 		 882 aa  190  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2042  DNA gyrase subunit A  34.73 
 
 		 893 aa  189  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.430376  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3009  DNA gyrase subunit A  33.06 
 
 		 878 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.354996  normal  0.0330044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1166  DNA gyrase subunit A  33.81 
 
 		 904 aa  190  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0659198  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0916  DNA gyrase subunit A  33.04 
 
 		 867 aa  190  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0920  DNA gyrase subunit A  33.04 
 
 		 867 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0820357 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0738  DNA gyrase subunit A  32.17 
 
 		 859 aa  190  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.958835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  29.36 
 
 		 829 aa  190  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15810  DNA gyrase subunit A  34.13 
 
 		 910 aa  189  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.872955  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  31.67 
 
 		 883 aa  189  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  27.87 
 
 		 823 aa  189  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  33.63 
 
 		 748 aa  189  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2123  DNA gyrase subunit A  34.43 
 
 		 893 aa  189  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  28.8 
 
 		 828 aa  189  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3280  DNA gyrase subunit A  32.78 
 
 		 886 aa  188  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.586239  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  33.62 
 
 		 913 aa  188  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  28.06 
 
 		 743 aa  189  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1396  DNA gyrase subunit A  32.78 
 
 		 877 aa  188  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.431905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1358  DNA gyrase subunit A  34.13 
 
 		 921 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.832857  normal  0.422434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  28.05 
 
 		 823 aa  188  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4153  DNA gyrase subunit A  33.04 
 
 		 867 aa  188  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  28.32 
 
 		 821 aa  188  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1040  DNA gyrase subunit A  33.04 
 
 		 867 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0999  DNA gyrase subunit A  33.04 
 
 		 851 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  28.88 
 
 		 871 aa  188  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1108  DNA topoisomerase IV subunit A  33.33 
 
 		 751 aa  188  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0561  DNA gyrase subunit A  33.04 
 
 		 867 aa  188  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>