More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1390 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  97.04 
 
 
835 aa  1651    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  42.57 
 
 
872 aa  643    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  44.2 
 
 
853 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 
843 aa  1711    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  42.69 
 
 
872 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  45.18 
 
 
857 aa  711    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  58.03 
 
 
835 aa  954    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  43.31 
 
 
872 aa  680    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  44.83 
 
 
828 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  44.58 
 
 
886 aa  643    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  49.82 
 
 
822 aa  714    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  44.68 
 
 
865 aa  660    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  42.61 
 
 
863 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  43.76 
 
 
856 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  53.25 
 
 
858 aa  832    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  43.09 
 
 
881 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  43.46 
 
 
863 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  45.18 
 
 
857 aa  711    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  56.67 
 
 
835 aa  954    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  43.71 
 
 
875 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  54.55 
 
 
839 aa  870    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  67.13 
 
 
848 aa  1152    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  42.93 
 
 
839 aa  647    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  43.01 
 
 
839 aa  650    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  57.03 
 
 
873 aa  971    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  43.36 
 
 
885 aa  660    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  51.16 
 
 
829 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  42.28 
 
 
865 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  44.48 
 
 
864 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  43.72 
 
 
802 aa  650    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  42.79 
 
 
865 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  43.04 
 
 
869 aa  668    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  41.06 
 
 
807 aa  632  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  43.74 
 
 
813 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  58.82 
 
 
827 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  42.04 
 
 
820 aa  628  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  58.62 
 
 
827 aa  628  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  64.93 
 
 
806 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  42.45 
 
 
814 aa  620  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  42.12 
 
 
807 aa  621  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  42.71 
 
 
813 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  41.37 
 
 
818 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  42.12 
 
 
812 aa  617  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  40.7 
 
 
814 aa  618  1e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  42.53 
 
 
813 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  40.24 
 
 
825 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  41.3 
 
 
836 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  43.14 
 
 
813 aa  615  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  41.12 
 
 
809 aa  609  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  40.99 
 
 
823 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  41.54 
 
 
827 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  39.57 
 
 
818 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  40.87 
 
 
823 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  40.87 
 
 
823 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  40.87 
 
 
823 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  40.5 
 
 
823 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  40.87 
 
 
823 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  41.68 
 
 
816 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  40.88 
 
 
836 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  40.71 
 
 
832 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  40.38 
 
 
821 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  40.5 
 
 
823 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  41.43 
 
 
835 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  39.28 
 
 
834 aa  605  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  41.89 
 
 
819 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  40.34 
 
 
823 aa  599  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  40.27 
 
 
829 aa  599  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  40.34 
 
 
823 aa  598  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  40.22 
 
 
823 aa  597  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  41.37 
 
 
824 aa  593  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  40.21 
 
 
901 aa  592  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  40.75 
 
 
816 aa  591  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  39.81 
 
 
811 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  38.86 
 
 
838 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  40.48 
 
 
823 aa  588  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  41.35 
 
 
796 aa  586  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  39.15 
 
 
809 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  41.2 
 
 
823 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  40.19 
 
 
815 aa  582  1e-164  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  39.7 
 
 
853 aa  579  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  39.66 
 
 
808 aa  582  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  39.02 
 
 
817 aa  580  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  38.83 
 
 
843 aa  579  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  38.5 
 
 
865 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  39.86 
 
 
875 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  39.83 
 
 
827 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  40.75 
 
 
809 aa  570  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  38.2 
 
 
857 aa  569  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  40.07 
 
 
828 aa  571  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  39.52 
 
 
828 aa  571  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  39.88 
 
 
830 aa  570  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  40.5 
 
 
809 aa  569  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  40.38 
 
 
852 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  38.78 
 
 
819 aa  566  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  40.68 
 
 
815 aa  566  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2474  DNA gyrase, A subunit  39.67 
 
 
805 aa  568  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000172995  decreased coverage  0.00702489 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  39.09 
 
 
826 aa  566  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2163  DNA gyrase, A subunit  38.07 
 
 
869 aa  568  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.612528 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  39.95 
 
 
816 aa  567  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  39.12 
 
 
848 aa  566  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>