More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_00041 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  71.83 
 
 		 813 aa  1173    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  47.72 
 
 		 827 aa  740    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.14 
 
 		 843 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  100 
 
 		 813 aa  1629    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  48.02 
 
 		 827 aa  738    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  46.13 
 
 		 835 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  46.56 
 
 		 806 aa  719    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  45.45 
 
 		 822 aa  728    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  85.24 
 
 		 813 aa  1368    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  44.84 
 
 		 858 aa  665    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  44.51 
 
 		 835 aa  676    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  48.51 
 
 		 829 aa  775    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  43.23 
 
 		 873 aa  647    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  89.05 
 
 		 813 aa  1419    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  47.8 
 
 		 828 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.4 
 
 		 835 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  42.42 
 
 		 839 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41.49 
 
 		 848 aa  615  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  44.67 
 
 		 856 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  44.37 
 
 		 865 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  44.51 
 
 		 869 aa  591  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  44.79 
 
 		 872 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  56.73 
 
 		 863 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  44.7 
 
 		 853 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  56.53 
 
 		 865 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  52.91 
 
 		 864 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  44.37 
 
 		 863 aa  578  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  43.76 
 
 		 857 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  44.66 
 
 		 881 aa  578  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  43.76 
 
 		 857 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  52.94 
 
 		 886 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  53.32 
 
 		 875 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  45.16 
 
 		 885 aa  573  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  44.9 
 
 		 872 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  52.55 
 
 		 865 aa  569  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  44.82 
 
 		 872 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  42.98 
 
 		 949 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28121  predicted protein  42.18 
 
 		 897 aa  542  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0542452  normal  0.0190346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  40.88 
 
 		 807 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  42.02 
 
 		 807 aa  538  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  40.99 
 
 		 809 aa  535  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  41.32 
 
 		 839 aa  528  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  41.66 
 
 		 816 aa  525  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  37.96 
 
 		 802 aa  525  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  41.32 
 
 		 839 aa  525  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  39.03 
 
 		 808 aa  523  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  40.05 
 
 		 809 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  37.87 
 
 		 820 aa  522  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  38.32 
 
 		 814 aa  518  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  39.32 
 
 		 824 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  47.35 
 
 		 825 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  39.76 
 
 		 827 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  46.25 
 
 		 818 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  39.43 
 
 		 796 aa  513  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  37.82 
 
 		 816 aa  513  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  39.86 
 
 		 823 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  39.86 
 
 		 823 aa  509  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  39.86 
 
 		 823 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  39.86 
 
 		 823 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 823 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  48.22 
 
 		 836 aa  511  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  38.79 
 
 		 812 aa  511  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  48.79 
 
 		 811 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  39.86 
 
 		 823 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  39.86 
 
 		 823 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  38.22 
 
 		 852 aa  509  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  48.22 
 
 		 836 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  49.29 
 
 		 901 aa  510  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  38.3 
 
 		 899 aa  511  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  37.16 
 
 		 834 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  39.86 
 
 		 823 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  38.32 
 
 		 809 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  39.86 
 
 		 823 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  39.86 
 
 		 823 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  39.02 
 
 		 809 aa  503  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  38.9 
 
 		 821 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  47.65 
 
 		 832 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  46.97 
 
 		 818 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  36.53 
 
 		 893 aa  500  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  37.65 
 
 		 856 aa  500  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  47.45 
 
 		 932 aa  499  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33633  predicted protein  37.5 
 
 		 818 aa  501  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303682  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  48.31 
 
 		 814 aa  500  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  39.92 
 
 		 841 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  37.62 
 
 		 864 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  38.92 
 
 		 809 aa  498  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1733  DNA gyrase, A subunit  39.06 
 
 		 804 aa  499  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.28256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3049  DNA gyrase, A subunit  43.39 
 
 		 965 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  40.38 
 
 		 830 aa  498  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  39.32 
 
 		 828 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  38.26 
 
 		 898 aa  498  1e-139  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1660  DNA gyrase, A subunit  38.93 
 
 		 804 aa  497  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00811487  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  40.96 
 
 		 806 aa  499  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  38.43 
 
 		 809 aa  498  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2871  DNA gyrase subunit A  35.83 
 
 		 922 aa  495  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236942  normal  0.0392982 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2151  DNA gyrase, A subunit  39.43 
 
 		 834 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186517  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  46.34 
 
 		 816 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  43.99 
 
 		 911 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4371  DNA gyrase subunit A  44.62 
 
 		 915 aa  495  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289021  normal  0.322943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3865  DNA gyrase subunit A  37.11 
 
 		 913 aa  495  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>