More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1367 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  42.55 
 
 
820 aa  662    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  42.6 
 
 
811 aa  655    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  40.41 
 
 
857 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  47.78 
 
 
828 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  40.94 
 
 
836 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  44.08 
 
 
865 aa  678    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  41.41 
 
 
860 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  43.06 
 
 
863 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  41.14 
 
 
823 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  41 
 
 
816 aa  639    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  42.39 
 
 
823 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  41.67 
 
 
856 aa  639    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  44.81 
 
 
875 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  44.95 
 
 
872 aa  676    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  41.14 
 
 
823 aa  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  41.14 
 
 
823 aa  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  41.26 
 
 
823 aa  655    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  42.47 
 
 
825 aa  655    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1372  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  40.87 
 
 
863 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1368  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  40.87 
 
 
863 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  42.35 
 
 
853 aa  646    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  44.26 
 
 
881 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  44.95 
 
 
872 aa  677    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  44.52 
 
 
827 aa  707    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  41.62 
 
 
828 aa  637    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.55 
 
 
843 aa  888    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  42.51 
 
 
808 aa  654    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  44.4 
 
 
827 aa  703    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  58.67 
 
 
835 aa  964    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  44.93 
 
 
872 aa  706    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  42.03 
 
 
864 aa  646    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  41.26 
 
 
823 aa  655    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  41.57 
 
 
835 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.9 
 
 
848 aa  929    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  51.3 
 
 
806 aa  698    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  44.55 
 
 
886 aa  662    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  49.7 
 
 
822 aa  728    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  45.47 
 
 
865 aa  671    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  45.1 
 
 
857 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  41.16 
 
 
828 aa  649    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  41.14 
 
 
823 aa  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  42.44 
 
 
807 aa  677    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  44.43 
 
 
863 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  45.04 
 
 
856 aa  689    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  53.11 
 
 
858 aa  827    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  52.12 
 
 
829 aa  737    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  43.18 
 
 
814 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1204  DNA gyrase, A subunit  42.26 
 
 
870 aa  641    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.41811  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  41.06 
 
 
836 aa  653    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  41.14 
 
 
823 aa  653    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  44.42 
 
 
824 aa  658    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  57.63 
 
 
835 aa  951    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  41.19 
 
 
818 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  41 
 
 
830 aa  635    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.21 
 
 
835 aa  882    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  42.55 
 
 
813 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  45.52 
 
 
864 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  41.5 
 
 
809 aa  645    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  45.1 
 
 
857 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  44.15 
 
 
818 aa  667    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  43.1 
 
 
807 aa  674    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  43.39 
 
 
839 aa  685    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  43.58 
 
 
839 aa  684    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  44.58 
 
 
802 aa  676    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  52.6 
 
 
873 aa  887    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  44.26 
 
 
885 aa  678    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  40.39 
 
 
827 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  41.81 
 
 
832 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  44.73 
 
 
853 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  100 
 
 
839 aa  1696    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  41.87 
 
 
812 aa  638    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  41.26 
 
 
823 aa  655    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  43.46 
 
 
816 aa  667    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  43.98 
 
 
812 aa  686    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  42.68 
 
 
823 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  40.78 
 
 
821 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  41.14 
 
 
823 aa  652    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  43.17 
 
 
796 aa  650    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  41.2 
 
 
819 aa  649    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  41.38 
 
 
823 aa  651    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  42.56 
 
 
901 aa  669    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  44.28 
 
 
809 aa  654    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  43.73 
 
 
865 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  42.26 
 
 
814 aa  648    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  45.18 
 
 
869 aa  707    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  42.51 
 
 
809 aa  633  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  40.49 
 
 
893 aa  632  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  42.42 
 
 
815 aa  629  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  41.74 
 
 
828 aa  630  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  41.53 
 
 
839 aa  629  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  42.14 
 
 
809 aa  631  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  40.66 
 
 
826 aa  630  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  42.18 
 
 
809 aa  630  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  40.64 
 
 
827 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  42.02 
 
 
809 aa  627  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  40.76 
 
 
875 aa  626  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1339  DNA gyrase, A subunit  41.87 
 
 
864 aa  625  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0126105  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  39.28 
 
 
838 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  41.82 
 
 
830 aa  627  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  40.59 
 
 
828 aa  627  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>