More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1901 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.53 
 
 		 848 aa  932    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  40.45 
 
 		 823 aa  638    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  43.24 
 
 		 865 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  56.05 
 
 		 835 aa  949    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  57.03 
 
 		 843 aa  971    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  43.21 
 
 		 872 aa  680    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  44.41 
 
 		 863 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  56.18 
 
 		 835 aa  957    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  42.39 
 
 		 872 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  41.62 
 
 		 807 aa  666    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  41.09 
 
 		 825 aa  635    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  66.11 
 
 		 806 aa  637    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  43.39 
 
 		 886 aa  687    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  62.83 
 
 		 822 aa  650    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  44.84 
 
 		 865 aa  709    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  44.03 
 
 		 863 aa  701    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  43.46 
 
 		 856 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  48.84 
 
 		 858 aa  781    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  40.49 
 
 		 823 aa  635    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  43.34 
 
 		 881 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  61.49 
 
 		 827 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  45.26 
 
 		 813 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  41.76 
 
 		 812 aa  644    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  44.08 
 
 		 875 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  40.61 
 
 		 823 aa  637    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  66.87 
 
 		 829 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  43.23 
 
 		 857 aa  703    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  43.1 
 
 		 872 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  42.18 
 
 		 839 aa  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  42.3 
 
 		 839 aa  647    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 873 aa  1776    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  42.89 
 
 		 885 aa  697    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  52.6 
 
 		 839 aa  869    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  43.88 
 
 		 853 aa  717    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  43.36 
 
 		 865 aa  689    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  44.27 
 
 		 864 aa  713    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  43.23 
 
 		 857 aa  703    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  41.98 
 
 		 802 aa  659    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  41.71 
 
 		 818 aa  644    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  42.54 
 
 		 869 aa  687    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  55.85 
 
 		 835 aa  964    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  40.49 
 
 		 823 aa  635  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  40.49 
 
 		 823 aa  635  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  40.49 
 
 		 823 aa  635  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  40.49 
 
 		 823 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  41.65 
 
 		 811 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  40.28 
 
 		 818 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  40.49 
 
 		 823 aa  635  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  40.49 
 
 		 823 aa  634  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  40.49 
 
 		 823 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  42.38 
 
 		 816 aa  634  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  60.25 
 
 		 828 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  40.48 
 
 		 812 aa  630  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  39.1 
 
 		 821 aa  626  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  40.98 
 
 		 807 aa  628  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  43.65 
 
 		 813 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  43.84 
 
 		 813 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  43.23 
 
 		 813 aa  621  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  40.16 
 
 		 827 aa  620  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  40.19 
 
 		 828 aa  609  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  41.72 
 
 		 820 aa  611  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  40.09 
 
 		 893 aa  608  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  40.19 
 
 		 835 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  39.84 
 
 		 814 aa  608  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  39.1 
 
 		 836 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  40.4 
 
 		 796 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  39.91 
 
 		 832 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  42.38 
 
 		 901 aa  603  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  38.86 
 
 		 836 aa  601  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  39.86 
 
 		 889 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  39.86 
 
 		 889 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  41.01 
 
 		 819 aa  601  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  40.9 
 
 		 816 aa  600  1e-170  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  39.22 
 
 		 838 aa  598  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  39.91 
 
 		 808 aa  593  1e-168  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  40.51 
 
 		 827 aa  594  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2163  DNA gyrase, A subunit  38.64 
 
 		 869 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.612528 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  40.12 
 
 		 816 aa  592  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  39.53 
 
 		 830 aa  591  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  41.39 
 
 		 852 aa  590  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  39.53 
 
 		 853 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  37.58 
 
 		 857 aa  586  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  39.68 
 
 		 840 aa  588  1e-166  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  40.45 
 
 		 814 aa  588  1e-166  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  41.06 
 
 		 824 aa  587  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  39.61 
 
 		 823 aa  587  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  39.44 
 
 		 899 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11138  DNA gyrase A subunit  38.82 
 
 		 848 aa  583  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185535  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  38.6 
 
 		 809 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  39.12 
 
 		 809 aa  580  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  39.52 
 
 		 838 aa  580  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 		 949 aa  580  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  37.44 
 
 		 857 aa  582  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  38.8 
 
 		 809 aa  581  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  39.58 
 
 		 823 aa  579  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  38.89 
 
 		 809 aa  581  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  39 
 
 		 827 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  37.75 
 
 		 864 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  38.87 
 
 		 875 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  38.88 
 
 		 828 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>