More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1694 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  54.72 
 
 		 829 aa  806    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  52.87 
 
 		 839 aa  825    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  44.84 
 
 		 813 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  45.43 
 
 		 813 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  45.45 
 
 		 827 aa  746    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  46.53 
 
 		 828 aa  757    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  54.03 
 
 		 835 aa  861    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  54.23 
 
 		 806 aa  766    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  54.29 
 
 		 822 aa  791    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  44.95 
 
 		 813 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  45.01 
 
 		 856 aa  640    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 858 aa  1709    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.55 
 
 		 835 aa  837    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.84 
 
 		 848 aa  849    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.48 
 
 		 843 aa  848    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  51.81 
 
 		 835 aa  845    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  49.07 
 
 		 873 aa  803    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  45.79 
 
 		 827 aa  745    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  63.03 
 
 		 813 aa  632  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  42.52 
 
 		 864 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  42.34 
 
 		 881 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  42.56 
 
 		 865 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  41.2 
 
 		 869 aa  614  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  60.99 
 
 		 853 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  43.97 
 
 		 865 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  42.35 
 
 		 863 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  42.74 
 
 		 857 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  42.74 
 
 		 857 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  44.87 
 
 		 872 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  42.07 
 
 		 863 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  41.71 
 
 		 802 aa  600  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  42.65 
 
 		 865 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  42.2 
 
 		 886 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  45.17 
 
 		 885 aa  597  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  43.58 
 
 		 875 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  39.7 
 
 		 818 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  41.63 
 
 		 872 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  41.51 
 
 		 872 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  37.76 
 
 		 807 aa  580  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  38.29 
 
 		 825 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  41.13 
 
 		 812 aa  575  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  37.53 
 
 		 818 aa  572  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  38.13 
 
 		 839 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  38.13 
 
 		 839 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  38.91 
 
 		 816 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 		 823 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 		 823 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 		 823 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 		 823 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  37.82 
 
 		 823 aa  560  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 		 823 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 		 823 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 		 823 aa  561  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  39.6 
 
 		 823 aa  561  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  37.82 
 
 		 823 aa  561  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  38.75 
 
 		 820 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  39.35 
 
 		 821 aa  558  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  39.06 
 
 		 809 aa  554  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  41.6 
 
 		 809 aa  552  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  38.23 
 
 		 899 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  40.28 
 
 		 824 aa  551  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  36.13 
 
 		 828 aa  551  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  36.59 
 
 		 808 aa  551  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  41.21 
 
 		 809 aa  545  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  36.23 
 
 		 814 aa  545  1e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  38.78 
 
 		 809 aa  545  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  38.66 
 
 		 827 aa  542  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  40.66 
 
 		 809 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  36.43 
 
 		 819 aa  541  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  38.86 
 
 		 807 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  36.88 
 
 		 816 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  39.06 
 
 		 796 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  38.49 
 
 		 835 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  38.65 
 
 		 830 aa  536  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  37.94 
 
 		 832 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  37.81 
 
 		 828 aa  535  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  38.04 
 
 		 838 aa  533  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  38.69 
 
 		 823 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  38.29 
 
 		 828 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  36.44 
 
 		 838 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  38.36 
 
 		 813 aa  533  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  52.06 
 
 		 809 aa  534  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  36.76 
 
 		 889 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  37.57 
 
 		 848 aa  531  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  41.9 
 
 		 913 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  36.99 
 
 		 836 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  37.06 
 
 		 857 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  37.03 
 
 		 827 aa  531  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  36.76 
 
 		 889 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  52.04 
 
 		 811 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  40.46 
 
 		 811 aa  527  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  38.01 
 
 		 932 aa  528  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  36.77 
 
 		 865 aa  528  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  38.58 
 
 		 852 aa  526  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  52.16 
 
 		 901 aa  527  1e-148  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  37.11 
 
 		 828 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0096  DNA gyrase, A subunit  38.4 
 
 		 827 aa  526  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180112  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  36.48 
 
 		 856 aa  526  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  41.77 
 
 		 913 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  52.26 
 
 		 814 aa  525  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>