More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_00041 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  89.05 
 
 
813 aa  1419    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.71 
 
 
843 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.96 
 
 
835 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  47.25 
 
 
827 aa  744    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  45.82 
 
 
835 aa  695    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  70.36 
 
 
813 aa  1160    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  45.07 
 
 
835 aa  687    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  45.41 
 
 
806 aa  721    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  44.82 
 
 
822 aa  741    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  84.75 
 
 
813 aa  1378    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  44.26 
 
 
858 aa  659    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  46.84 
 
 
829 aa  765    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  43.65 
 
 
873 aa  651    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  47.6 
 
 
827 aa  748    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  47.51 
 
 
828 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  100 
 
 
813 aa  1628    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.12 
 
 
848 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  41.83 
 
 
839 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  44.9 
 
 
856 aa  602  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  44.37 
 
 
865 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  52.69 
 
 
863 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  40.62 
 
 
865 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  44.98 
 
 
853 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  45.02 
 
 
863 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  43.91 
 
 
872 aa  581  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  52.08 
 
 
886 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  52.64 
 
 
875 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  43.5 
 
 
864 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  52.26 
 
 
865 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  43.63 
 
 
869 aa  577  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  44.08 
 
 
881 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  44.26 
 
 
872 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  43.62 
 
 
857 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  43.62 
 
 
857 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  44.4 
 
 
872 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  44.54 
 
 
885 aa  564  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28121  predicted protein  42.07 
 
 
897 aa  548  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0542452  normal  0.0190346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  40.55 
 
 
807 aa  545  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  39.29 
 
 
807 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  42.04 
 
 
949 aa  538  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  39.66 
 
 
808 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  40.93 
 
 
796 aa  526  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  40.64 
 
 
809 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  38.47 
 
 
839 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  45.58 
 
 
820 aa  525  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  40.91 
 
 
816 aa  522  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  39.54 
 
 
818 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  38.05 
 
 
802 aa  520  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  38.47 
 
 
839 aa  522  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  40.05 
 
 
825 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  47.15 
 
 
811 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  46.06 
 
 
814 aa  518  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  39.8 
 
 
899 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  35.5 
 
 
816 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  39.41 
 
 
827 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  48.11 
 
 
818 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  39.38 
 
 
809 aa  511  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  39.7 
 
 
809 aa  511  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  39.04 
 
 
824 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  47.3 
 
 
812 aa  511  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3049  DNA gyrase, A subunit  42.08 
 
 
965 aa  509  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 
823 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 
823 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 
823 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 
823 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 
823 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 
823 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 
823 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 
823 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  46.18 
 
 
836 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  45.84 
 
 
836 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  39.53 
 
 
823 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 
823 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  38.7 
 
 
809 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  39.18 
 
 
809 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  38.99 
 
 
809 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  38.84 
 
 
821 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  40.03 
 
 
828 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3865  DNA gyrase subunit A  37.33 
 
 
913 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  43.74 
 
 
893 aa  502  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  41.02 
 
 
806 aa  500  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1764  DNA gyrase subunit A  38.87 
 
 
913 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.314085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  37.59 
 
 
852 aa  501  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2871  DNA gyrase subunit A  35.54 
 
 
922 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236942  normal  0.0392982 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  34.87 
 
 
834 aa  498  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 
913 aa  498  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  44.55 
 
 
835 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  37.62 
 
 
927 aa  497  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  40.14 
 
 
830 aa  498  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2596  DNA gyrase subunit A  38.42 
 
 
917 aa  499  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0785629 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  37.79 
 
 
816 aa  496  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  38.6 
 
 
932 aa  498  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  44.54 
 
 
922 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  43.4 
 
 
889 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1733  DNA gyrase, A subunit  38.57 
 
 
804 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.28256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  37.11 
 
 
811 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  37.94 
 
 
911 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  44.19 
 
 
923 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  38.61 
 
 
828 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  38.97 
 
 
827 aa  495  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>