More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00041 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  48.05 
 
 		 813 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  60.17 
 
 		 827 aa  1023    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  62.38 
 
 		 829 aa  1101    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  60.29 
 
 		 827 aa  1022    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  47.78 
 
 		 835 aa  769    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  100 
 
 		 828 aa  1672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  59.58 
 
 		 806 aa  992    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  47.45 
 
 		 839 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  61.85 
 
 		 822 aa  1056    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  47.02 
 
 		 813 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  46.41 
 
 		 858 aa  741    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.75 
 
 		 835 aa  688    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.89 
 
 		 848 aa  714    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.83 
 
 		 843 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  46.63 
 
 		 835 aa  740    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  47.51 
 
 		 813 aa  726    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  47.8 
 
 		 813 aa  727    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  60.25 
 
 		 873 aa  630  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  45.48 
 
 		 864 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  45.45 
 
 		 863 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  44.52 
 
 		 865 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  44.55 
 
 		 872 aa  592  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  44.25 
 
 		 863 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  44.66 
 
 		 865 aa  585  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  44.66 
 
 		 869 aa  585  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  45.71 
 
 		 885 aa  580  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  44.83 
 
 		 853 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  56.57 
 
 		 856 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  55.44 
 
 		 857 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  55.44 
 
 		 857 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  44.86 
 
 		 886 aa  562  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  44.72 
 
 		 865 aa  562  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  44.31 
 
 		 875 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  44.17 
 
 		 872 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  44.31 
 
 		 872 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  40.83 
 
 		 802 aa  556  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  43.39 
 
 		 881 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  41.81 
 
 		 808 aa  546  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  40.32 
 
 		 807 aa  533  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  38.34 
 
 		 807 aa  529  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  40.48 
 
 		 812 aa  525  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  40.86 
 
 		 811 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  38.44 
 
 		 818 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  38.4 
 
 		 839 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  38.4 
 
 		 839 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  37.85 
 
 		 825 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  37.87 
 
 		 823 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  37.87 
 
 		 823 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  37.87 
 
 		 823 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  37.56 
 
 		 823 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  37.87 
 
 		 823 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  37.87 
 
 		 823 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  37.32 
 
 		 820 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  37.44 
 
 		 823 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  37.65 
 
 		 823 aa  515  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  37.38 
 
 		 823 aa  515  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  37.9 
 
 		 823 aa  515  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  37.07 
 
 		 816 aa  514  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  50.41 
 
 		 832 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  38.87 
 
 		 809 aa  510  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  38.5 
 
 		 818 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  38.16 
 
 		 901 aa  509  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  37.66 
 
 		 827 aa  511  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  50.21 
 
 		 809 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  49.59 
 
 		 809 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  39.68 
 
 		 814 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  38.62 
 
 		 813 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  49.79 
 
 		 809 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  37.23 
 
 		 821 aa  505  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  38.08 
 
 		 809 aa  504  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  50.2 
 
 		 835 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2871  DNA gyrase subunit A  37.65 
 
 		 922 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236942  normal  0.0392982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  49.38 
 
 		 836 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1339  DNA gyrase, A subunit  37.29 
 
 		 864 aa  506  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0126105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  39.21 
 
 		 899 aa  501  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  37.38 
 
 		 864 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  49.38 
 
 		 836 aa  502  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  49.49 
 
 		 809 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  51.24 
 
 		 816 aa  502  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1170  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  38.93 
 
 		 793 aa  502  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000163791  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  37.13 
 
 		 840 aa  497  1e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  40.21 
 
 		 932 aa  498  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  38.7 
 
 		 949 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0948  DNA gyrase subunit A  37.5 
 
 		 849 aa  498  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2189  DNA gyrase subunit A  37.83 
 
 		 893 aa  499  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0371  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  39.79 
 
 		 766 aa  498  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  48.13 
 
 		 828 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  37.94 
 
 		 824 aa  499  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  38.16 
 
 		 816 aa  498  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  36.92 
 
 		 834 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  37.42 
 
 		 913 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  38.15 
 
 		 834 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  37.86 
 
 		 839 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4447  DNA gyrase, A subunit  37.4 
 
 		 914 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.950017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  37.34 
 
 		 857 aa  490  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  37.12 
 
 		 860 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  37.8 
 
 		 913 aa  489  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28121  predicted protein  47.75 
 
 		 897 aa  492  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0542452  normal  0.0190346 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  39.16 
 
 		 796 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3049  DNA gyrase, A subunit  38.23 
 
 		 965 aa  492  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>