More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_00041 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  50.66 
 
 		 827 aa  762    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.68 
 
 		 835 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  45.95 
 
 		 835 aa  704    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  46.62 
 
 		 806 aa  734    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  46.76 
 
 		 822 aa  762    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  72.08 
 
 		 813 aa  1159    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  62.22 
 
 		 858 aa  660    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  71.83 
 
 		 813 aa  1154    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  45.26 
 
 		 873 aa  653    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  48.05 
 
 		 828 aa  750    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  49.01 
 
 		 829 aa  790    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.74 
 
 		 843 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  44.94 
 
 		 835 aa  672    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  70.36 
 
 		 813 aa  1142    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  100 
 
 		 813 aa  1622    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  51.14 
 
 		 827 aa  770    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  42.19 
 
 		 839 aa  635  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.84 
 
 		 848 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  44.79 
 
 		 853 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  58.42 
 
 		 856 aa  611  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  46.12 
 
 		 869 aa  601  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  46.01 
 
 		 864 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  45.94 
 
 		 872 aa  602  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  45.14 
 
 		 857 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  45.14 
 
 		 857 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  44.68 
 
 		 863 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  44.8 
 
 		 865 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  56.63 
 
 		 886 aa  588  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  45.08 
 
 		 875 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  44.34 
 
 		 881 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  45.47 
 
 		 872 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  45.19 
 
 		 865 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  44.94 
 
 		 863 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  45.79 
 
 		 885 aa  585  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  45.08 
 
 		 865 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  45.33 
 
 		 872 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  43.45 
 
 		 807 aa  571  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  42.63 
 
 		 807 aa  558  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  40.17 
 
 		 839 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  40.17 
 
 		 839 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  40 
 
 		 816 aa  549  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  41.1 
 
 		 827 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  40.58 
 
 		 809 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  38.01 
 
 		 820 aa  541  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  39.61 
 
 		 802 aa  540  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  39.7 
 
 		 814 aa  532  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  38.31 
 
 		 836 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  38.18 
 
 		 836 aa  535  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  41.17 
 
 		 949 aa  532  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28121  predicted protein  44.97 
 
 		 897 aa  531  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0542452  normal  0.0190346 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  41.26 
 
 		 811 aa  532  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  39.95 
 
 		 812 aa  531  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  39.13 
 
 		 852 aa  527  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  39.73 
 
 		 825 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  39.2 
 
 		 818 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 823 aa  522  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  39.54 
 
 		 818 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 823 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 823 aa  522  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  40.13 
 
 		 823 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  40.13 
 
 		 823 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 823 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  38.47 
 
 		 832 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  39.7 
 
 		 823 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  39.75 
 
 		 821 aa  521  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  40.13 
 
 		 823 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 823 aa  522  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 823 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  38.9 
 
 		 912 aa  521  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  39.95 
 
 		 796 aa  519  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  37.18 
 
 		 809 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  38.54 
 
 		 913 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2871  DNA gyrase subunit A  37.9 
 
 		 922 aa  518  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236942  normal  0.0392982 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  39.36 
 
 		 835 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  38.02 
 
 		 824 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  37.55 
 
 		 828 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  43.52 
 
 		 814 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  37.7 
 
 		 827 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  38.48 
 
 		 853 aa  512  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  39.4 
 
 		 834 aa  513  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  38.88 
 
 		 932 aa  514  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  39.52 
 
 		 901 aa  512  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3865  DNA gyrase subunit A  37.88 
 
 		 913 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  38.26 
 
 		 809 aa  515  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  39.01 
 
 		 809 aa  510  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  39.38 
 
 		 913 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  39.32 
 
 		 828 aa  510  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2876  DNA gyrase subunit A  39.87 
 
 		 925 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.987294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  41.27 
 
 		 830 aa  510  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2596  DNA gyrase subunit A  39.55 
 
 		 917 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0785629 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  40.7 
 
 		 808 aa  512  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  39.03 
 
 		 828 aa  512  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  35.26 
 
 		 816 aa  510  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  38.82 
 
 		 893 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  37.96 
 
 		 828 aa  509  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  38.23 
 
 		 841 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  39.25 
 
 		 913 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2494  DNA gyrase subunit A  38.79 
 
 		 919 aa  508  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  0.164499 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1764  DNA gyrase subunit A  39.25 
 
 		 913 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.314085  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  37.89 
 
 		 927 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>