More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_00041 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.35 
 
 
848 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  97.94 
 
 
827 aa  1630    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  45.44 
 
 
835 aa  713    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  47.72 
 
 
813 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  54.43 
 
 
806 aa  900    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  56.66 
 
 
822 aa  963    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  57.44 
 
 
829 aa  997    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  47.78 
 
 
813 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  45.68 
 
 
858 aa  728    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  47.6 
 
 
813 aa  722    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  46.38 
 
 
835 aa  711    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  44.4 
 
 
839 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  61.49 
 
 
873 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  100 
 
 
827 aa  1655    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  60.17 
 
 
828 aa  1023    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  51.14 
 
 
813 aa  756    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.13 
 
 
835 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  58.82 
 
 
843 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  45.55 
 
 
864 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  42.48 
 
 
865 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  40.28 
 
 
856 aa  609  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  41.88 
 
 
863 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  44.69 
 
 
872 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  42.48 
 
 
853 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  46.51 
 
 
865 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  45.59 
 
 
865 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  41.63 
 
 
863 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  44.43 
 
 
869 aa  595  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  45.13 
 
 
886 aa  590  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  44.35 
 
 
857 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  44.35 
 
 
857 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  42.12 
 
 
872 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  41.17 
 
 
875 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  41.88 
 
 
872 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  44.94 
 
 
885 aa  585  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  45.58 
 
 
881 aa  585  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  39.75 
 
 
802 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  38.54 
 
 
807 aa  546  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  39.56 
 
 
818 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  40.26 
 
 
811 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33633  predicted protein  39.56 
 
 
818 aa  536  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  39.03 
 
 
820 aa  534  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  40.47 
 
 
825 aa  535  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  39.66 
 
 
812 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  38.72 
 
 
808 aa  531  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  39.51 
 
 
807 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  40.61 
 
 
816 aa  527  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  39.16 
 
 
839 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  39.16 
 
 
839 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  39.29 
 
 
818 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28121  predicted protein  49.49 
 
 
897 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0542452  normal  0.0190346 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 
823 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  37.81 
 
 
823 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  38.07 
 
 
864 aa  512  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  37.3 
 
 
823 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  37.81 
 
 
823 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  37.81 
 
 
823 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  37.81 
 
 
823 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  38.56 
 
 
871 aa  511  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  37.81 
 
 
823 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  38.12 
 
 
814 aa  510  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  37.81 
 
 
823 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  40.44 
 
 
830 aa  509  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 
823 aa  512  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  39.28 
 
 
819 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4317  DNA gyrase, A subunit  39.22 
 
 
914 aa  512  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  37.44 
 
 
809 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  51.14 
 
 
832 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  38.71 
 
 
821 aa  509  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4447  DNA gyrase, A subunit  37.85 
 
 
914 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.950017 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  38.4 
 
 
913 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 
823 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  36.82 
 
 
865 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  37.88 
 
 
816 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  50.93 
 
 
836 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  37.99 
 
 
809 aa  509  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  50.52 
 
 
836 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  38.29 
 
 
811 aa  504  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  38.31 
 
 
809 aa  503  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 
827 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  51.02 
 
 
824 aa  503  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  40.57 
 
 
814 aa  504  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  37.81 
 
 
809 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  37.17 
 
 
823 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  37.32 
 
 
901 aa  504  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  35.7 
 
 
860 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4371  DNA gyrase subunit A  38.34 
 
 
915 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289021  normal  0.322943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  37.99 
 
 
911 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  38.38 
 
 
949 aa  500  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2871  DNA gyrase subunit A  35.86 
 
 
922 aa  501  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236942  normal  0.0392982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1795  DNA gyrase subunit A  36.85 
 
 
880 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979791  unclonable  0.00000642236 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1764  DNA gyrase subunit A  37.83 
 
 
913 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.314085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  37.09 
 
 
813 aa  502  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  38.13 
 
 
913 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1166  DNA gyrase subunit A  37.15 
 
 
904 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0659198  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4719  DNA gyrase subunit A  37.75 
 
 
888 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.902316 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1287  DNA gyrase subunit A  37.15 
 
 
907 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2630  DNA gyrase subunit A  37.15 
 
 
907 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  35.83 
 
 
882 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  37.37 
 
 
816 aa  498  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>