More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1332 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  57.2 
 
 		 829 aa  994    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  50.66 
 
 		 813 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  60.29 
 
 		 828 aa  1022    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 827 aa  1657    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  45.64 
 
 		 835 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  54.06 
 
 		 806 aa  897    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  56.53 
 
 		 822 aa  965    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  47.61 
 
 		 813 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  45.34 
 
 		 858 aa  729    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  48.02 
 
 		 813 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.17 
 
 		 835 aa  680    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.29 
 
 		 848 aa  683    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  47.25 
 
 		 813 aa  717    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  97.94 
 
 		 827 aa  1630    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  44.52 
 
 		 839 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  46.1 
 
 		 835 aa  706    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  58.62 
 
 		 843 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  45.86 
 
 		 864 aa  612  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  42.72 
 
 		 865 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  44.83 
 
 		 872 aa  605  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  40.17 
 
 		 856 aa  608  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  41.52 
 
 		 863 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  46.23 
 
 		 865 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  42.68 
 
 		 853 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  44.11 
 
 		 869 aa  595  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  45.45 
 
 		 865 aa  595  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  41.43 
 
 		 863 aa  595  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  44.99 
 
 		 886 aa  589  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  44.49 
 
 		 857 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  44.49 
 
 		 857 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  41.76 
 
 		 872 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  41.88 
 
 		 872 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  45.47 
 
 		 881 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  45.13 
 
 		 875 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  45.08 
 
 		 885 aa  581  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  40.79 
 
 		 802 aa  561  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  39.97 
 
 		 818 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  37.96 
 
 		 807 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  39.87 
 
 		 811 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  40.39 
 
 		 825 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  39.5 
 
 		 807 aa  532  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33633  predicted protein  39.05 
 
 		 818 aa  533  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  39.63 
 
 		 812 aa  532  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  38.56 
 
 		 820 aa  533  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  40.08 
 
 		 808 aa  529  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  40.45 
 
 		 816 aa  529  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  39.22 
 
 		 839 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  39.22 
 
 		 839 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  38.63 
 
 		 818 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28121  predicted protein  49.28 
 
 		 897 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0542452  normal  0.0190346 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  37.99 
 
 		 809 aa  512  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  38.9 
 
 		 823 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  38.76 
 
 		 823 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  38.76 
 
 		 823 aa  515  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 		 864 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  37.72 
 
 		 823 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  38.45 
 
 		 821 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  38.76 
 
 		 823 aa  512  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  38.76 
 
 		 823 aa  512  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  38.76 
 
 		 823 aa  512  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  37.19 
 
 		 809 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  39.25 
 
 		 819 aa  511  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4317  DNA gyrase, A subunit  39.09 
 
 		 914 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  38.76 
 
 		 823 aa  512  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  38.76 
 
 		 823 aa  512  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  37.86 
 
 		 814 aa  512  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  40.81 
 
 		 830 aa  512  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  38.9 
 
 		 823 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  38.53 
 
 		 913 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  38.4 
 
 		 871 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  50.52 
 
 		 832 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4447  DNA gyrase, A subunit  37.99 
 
 		 914 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.950017 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  38.45 
 
 		 811 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  38.63 
 
 		 836 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  38.37 
 
 		 836 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  38.5 
 
 		 949 aa  504  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  36.6 
 
 		 865 aa  505  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  37.34 
 
 		 827 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  36.69 
 
 		 813 aa  505  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  38.75 
 
 		 809 aa  505  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  50.82 
 
 		 824 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  40.08 
 
 		 814 aa  501  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  38 
 
 		 913 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  36.92 
 
 		 901 aa  500  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  38.12 
 
 		 911 aa  502  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  50 
 
 		 796 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0540  DNA gyrase subunit A  37.62 
 
 		 930 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0267481  normal  0.364195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  37.8 
 
 		 927 aa  502  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  36.3 
 
 		 828 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1764  DNA gyrase subunit A  37.83 
 
 		 913 aa  502  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.314085  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  49.9 
 
 		 816 aa  499  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4371  DNA gyrase subunit A  38.34 
 
 		 915 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289021  normal  0.322943 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  47.77 
 
 		 809 aa  498  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  47.57 
 
 		 809 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2189  DNA gyrase subunit A  36.72 
 
 		 893 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  36.51 
 
 		 913 aa  497  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1795  DNA gyrase subunit A  36.73 
 
 		 880 aa  498  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979791  unclonable  0.00000642236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  35.83 
 
 		 882 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1287  DNA gyrase subunit A  37.02 
 
 		 907 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  37.4 
 
 		 827 aa  497  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>