More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28121 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  43.67 
 
 
875 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  44.59 
 
 
881 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  42.71 
 
 
869 aa  683    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  43.31 
 
 
872 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  42.94 
 
 
865 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  44.6 
 
 
857 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  43.52 
 
 
872 aa  716    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  42.82 
 
 
863 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  43.05 
 
 
865 aa  673    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  42.69 
 
 
886 aa  670    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  43.32 
 
 
865 aa  670    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  43.61 
 
 
863 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  44.43 
 
 
856 aa  710    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  44.6 
 
 
857 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28121  predicted protein  100 
 
 
897 aa  1826    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0542452  normal  0.0190346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  44.51 
 
 
853 aa  711    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  44 
 
 
885 aa  678    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  43.43 
 
 
872 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  43.75 
 
 
864 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  40.49 
 
 
802 aa  614  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  40.12 
 
 
818 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  40.46 
 
 
814 aa  597  1e-169  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  40.62 
 
 
809 aa  593  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  40.44 
 
 
812 aa  594  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  40.21 
 
 
807 aa  594  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  39.35 
 
 
835 aa  587  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  39.07 
 
 
825 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  39.52 
 
 
821 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  39.52 
 
 
824 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  40.34 
 
 
835 aa  585  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  39.51 
 
 
839 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  39.19 
 
 
823 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 
898 aa  581  1e-164  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  39.7 
 
 
814 aa  580  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 
839 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  39.07 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  39.07 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  39.07 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  39.09 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  39.07 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  39.03 
 
 
820 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  39.07 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  38.85 
 
 
901 aa  578  1.0000000000000001e-163  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  39.19 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  39.33 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  39.09 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  37.78 
 
 
893 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  37.69 
 
 
816 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  38.96 
 
 
853 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  38.61 
 
 
848 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  39.13 
 
 
836 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  39.78 
 
 
819 aa  571  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  39 
 
 
836 aa  572  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  40.56 
 
 
832 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  39.1 
 
 
816 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  44.91 
 
 
839 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  39.86 
 
 
796 aa  566  1e-160  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 
827 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  40.02 
 
 
809 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0901  DNA gyrase subunit A  38.75 
 
 
885 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.018045  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.51 
 
 
835 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  38.34 
 
 
816 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  37.79 
 
 
864 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  37.82 
 
 
807 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  38.38 
 
 
811 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  37.23 
 
 
818 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  38.08 
 
 
928 aa  561  1e-158  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0842  DNA gyrase subunit A  37.84 
 
 
889 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18082  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0771  DNA gyrase subunit A  37.84 
 
 
889 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.380841  hitchhiker  0.00768544 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  39.66 
 
 
809 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  37.47 
 
 
829 aa  560  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5446  DNA gyrase, A subunit  36.72 
 
 
859 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328113  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  36.96 
 
 
879 aa  556  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  37.12 
 
 
889 aa  557  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3049  DNA gyrase, A subunit  38.61 
 
 
965 aa  558  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  38.39 
 
 
828 aa  556  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1744  DNA gyrase subunit A  39.55 
 
 
943 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2123  DNA gyrase subunit A  38.21 
 
 
893 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155054  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  36.28 
 
 
907 aa  556  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  39.71 
 
 
809 aa  558  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  37.12 
 
 
889 aa  557  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  39.77 
 
 
904 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  39.47 
 
 
859 aa  555  1e-156  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  37.97 
 
 
819 aa  555  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2042  DNA gyrase subunit A  37.98 
 
 
893 aa  554  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.430376  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  39.27 
 
 
932 aa  553  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  37.98 
 
 
913 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  37.53 
 
 
871 aa  555  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33633  predicted protein  38.71 
 
 
818 aa  554  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  39.63 
 
 
848 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  37.28 
 
 
865 aa  553  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  38.68 
 
 
873 aa  553  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2163  DNA gyrase, A subunit  37.46 
 
 
869 aa  555  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.612528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  39.74 
 
 
843 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1202  DNA gyrase subunit A  37.2 
 
 
900 aa  552  1e-155  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  38.62 
 
 
835 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  38.55 
 
 
934 aa  551  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  38.75 
 
 
828 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  38.43 
 
 
836 aa  551  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  37.03 
 
 
848 aa  551  1e-155  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>