More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1920 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1920  thymidylate kinase  100 
 
 		 194 aa  375  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  39.36 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  38.78 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  41.15 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  34.46 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  40.88 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  34.27 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  38.5 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  39.29 
 
 		 210 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  36.59 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  38.78 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  37.24 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  33.82 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  38.27 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  35.1 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  31.75 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  40.24 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  33.17 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  33.82 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  41.42 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  34.62 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  36.73 
 
 		 216 aa  95.9  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  32.62 
 
 		 219 aa  95.9  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  34.43 
 
 		 226 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  40 
 
 		 215 aa  95.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  38.54 
 
 		 210 aa  95.1  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  30.2 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  30.92 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  40.24 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  34.57 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  37.93 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  32.55 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  35.98 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  33.65 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  36.14 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  34.95 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  35.92 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  36.73 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  31.28 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  33.33 
 
 		 214 aa  91.7  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  39.01 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  35.64 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  36.45 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  34.45 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  34.85 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  36.79 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  39.39 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  38.01 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  32.28 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  39.11 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  37.5 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  33.67 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  31.98 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  31.5 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  33.67 
 
 		 236 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  32.37 
 
 		 221 aa  88.2  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  29.5 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  36.55 
 
 		 219 aa  87.8  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  38.02 
 
 		 244 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  35.47 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  32.14 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  36.2 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  36.41 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  35.33 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  38.32 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  31.89 
 
 		 219 aa  85.9  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  30.5 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  35.38 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  35.23 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  39.6 
 
 		 217 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  35.23 
 
 		 212 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  39.6 
 
 		 217 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  35.23 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  32.2 
 
 		 197 aa  85.1  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1592  thymidylate kinase  38.73 
 
 		 217 aa  85.1  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  33.33 
 
 		 212 aa  84.7  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  37.43 
 
 		 215 aa  84.7  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  29.5 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  33.68 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  35.64 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  32.28 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  34.36 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  33.68 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0431  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.19831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  37.8 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  37 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  32.31 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  32.02 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  29.52 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  39.5 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  28.89 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  34.72 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  36.31 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  34.63 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  32.77 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  36.63 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  35.84 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>