5626 genes were found for organism Polaromonas sp. JS666



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Fosmid unclonability p-value

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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bpro_0001  CDS  NC_007948  40  1434  1395  chromosomal replication initiation protein  YP_546866  normal  normal  0.789649  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0002  CDS  NC_007948  1723  2829  1107  DNA polymerase III, beta subunit  YP_546867  normal  0.0963742  normal  0.484906  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0003  CDS  NC_007948  2944  5568  2625  DNA gyrase subunit B  YP_546868  normal  0.0319468  normal  0.972723  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0004  CDS  NC_007948  5583  7565  1983  hypothetical protein  YP_546869  normal  0.0778574  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0005  CDS  NC_007948  7574  8014  441  hypothetical protein  YP_546870  normal  0.564158  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0006  CDS  NC_007948  8077  8559  483  hypothetical protein  YP_546871  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0007  CDS  NC_007948  8675  8914  240  hypothetical protein  YP_546872  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0008  CDS  NC_007948  9217  9795  579  NnrU  YP_546873  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0009  CDS  NC_007948  9806  10417  612  DNA polymerase III, epsilon subunit  YP_546874  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0010  CDS  NC_007948  10619  10816  198  hypothetical protein  YP_546875  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0011  CDS  NC_007948  10874  12052  1179  ATPase  YP_546876  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0012  CDS  NC_007948  12199  12507  309  prevent-host-death protein  YP_546877  normal  normal  0.93374  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0013  CDS  NC_007948  12504  12926  423  PilT protein-like  YP_546878  normal  normal  0.96964  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0014  CDS  NC_007948  13100  14320  1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  YP_546879  normal  normal  0.446578  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0015  CDS  NC_007948  14503  15492  990  hypothetical protein  YP_546880  normal  0.22908  normal  0.261256  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0016  CDS  NC_007948  15672  16328  657  hypothetical protein  YP_546881  normal  0.614015  normal  0.241762  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0017  CDS  NC_007948  16482  18260  1779  2-octaprenylphenol hydroxylase  YP_546882  normal  normal  0.300768  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0018  CDS  NC_007948  18471  18731  261  cell division topological specificity factor MinE  YP_546883  normal  0.62898  normal  0.229437  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0019  CDS  NC_007948  18736  19554  819  septum site-determining protein MinD  YP_546884  normal  0.324829  normal  0.413105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0020  CDS  NC_007948  19602  20399  798  septum site-determining protein MinC  YP_546885  normal  0.973742  normal  0.645527  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0021  CDS  NC_007948  20761  21927  1167  metallophosphoesterase  YP_546886  normal  normal  0.713648  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0022  CDS  NC_007948  22027  22536  510  hypothetical protein  YP_546887  normal  0.735912  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0023  CDS  NC_007948  22740  23120  381  hypothetical protein  YP_546888  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0024  CDS  NC_007948  23414  24430  1017  hypothetical protein  YP_546889  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0025  CDS  NC_007948  24438  25748  1311  cardiolipin synthase 2  YP_546890  normal  normal  0.679584  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0026  CDS  NC_007948  25975  26778  804  endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_546891  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0027  CDS  NC_007948  27556  28011  456  60S ribosomal protein L19  YP_546892  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0028  CDS  NC_007948  28114  29184  1071  NADPH-dependent FMN reductase  YP_546893  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0029  CDS  NC_007948  29716  30282  567  hypothetical protein  YP_546894  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0030  CDS  NC_007948  30702  31676  975  recombination associated protein  YP_546895  normal  0.847391  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0031  CDS  NC_007948  31696  33045  1350  type III effector Hrp-dependent outers  YP_546896  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0032  CDS  NC_007948  33048  34334  1287  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  YP_546897  normal  0.729398  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0033  CDS  NC_007948  34346  34885  540  hypothetical protein  YP_546898  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0034  CDS  NC_007948  34935  36818  1884  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  YP_546899  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0035  CDS  NC_007948  37198  38217  1020  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  YP_546900  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0036  CDS  NC_007948  38331  39395  1065  LacI family transcription regulator  YP_546901  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0037  CDS  NC_007948  39663  41579  1917  thiamine biosynthesis protein ThiC  YP_546902  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0038  CDS  NC_007948  41740  42801  1062  FAD dependent oxidoreductase  YP_546903  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0039  CDS  NC_007948  42777  43025  249  hypothetical protein  YP_546904  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0040  CDS  NC_007948  43149  43964  816  thiazole synthase  YP_546905  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0041  CDS  NC_007948  44115  44762  648  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  YP_546906  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0042  CDS  NC_007948  44836  45432  597  hemerythrin HHE cation binding region  YP_546907  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0043  CDS  NC_007948  45480  45866  387  hypothetical protein  YP_546908  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0044  CDS  NC_007948  46179  47336  1158  peptidase M20D, amidohydrolase  YP_546909  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0045  CDS  NC_007948  47348  48058  711  HAD family hydrolase  YP_546910  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0046  CDS  NC_007948  48118  48513  396  AraC family transcriptional regulator  YP_546911  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0047  CDS  NC_007948  48710  49069  360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  YP_546912  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0048  CDS  NC_007948  49129  50259  1131  FAD dependent oxidoreductase  YP_546913  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0049  CDS  NC_007948  50256  51632  1377  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  YP_546914  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0050  CDS  NC_007948  51629  51955  327  hypothetical protein  YP_546915  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0051  CDS  NC_007948  51994  52488  495  AsnC family transcriptional regulator  YP_546916  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0052  CDS  NC_007948  52521  53906  1386  hypothetical protein  YP_546917  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0053  CDS  NC_007948  54049  54975  927  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  YP_546918  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0054  CDS  NC_007948  55004  55879  876  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_546919  normal  0.699783  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0055  CDS  NC_007948  56105  57601  1497  betaine-aldehyde dehydrogenase  YP_546920  normal  0.103268  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0056  CDS  NC_007948  57853  58518  666  haloacid dehalogenase, type II  YP_546921  normal  0.423045  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0057  CDS  NC_007948  58536  59825  1290  FAD dependent oxidoreductase  YP_546922  normal  0.610383  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0058  CDS  NC_007948  59868  61487  1620  extracellular solute-binding protein  YP_546923  normal  0.112335  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0059  CDS  NC_007948  61678  62634  957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_546924  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0060  CDS  NC_007948  62631  63506  876  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_546925  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0061  CDS  NC_007948  63506  65332  1827  ABC transporter related  YP_546926  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0062  CDS  NC_007948  65371  66849  1479  succinate semialdehyde dehydrogenase  YP_546927  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0063  CDS  NC_007948  66905  68005  1101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_546928  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0064  CDS  NC_007948  68339  68812  474  cytochrome c family protein, putative  YP_546929  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0065  CDS  NC_007948  69250  70635  1386  hypothetical protein  YP_546930  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0066  CDS  NC_007948  70905  71090  186  hypothetical protein  YP_546931  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0067  CDS  NC_007948  71091  71492  402  hypothetical protein  YP_546932  normal  0.908201  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0068  CDS  NC_007948  71565  72410  846  transglutaminase-like  YP_546933  normal  0.641599  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0069  CDS  NC_007948  72477  73247  771  class II aldolase/adducin-like  YP_546934  normal  0.872153  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0070  CDS  NC_007948  73407  74297  891  LysR family transcriptional regulator  YP_546935  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0071  CDS  NC_007948  74624  74881  258  hypothetical protein  YP_546936  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0072  CDS  NC_007948  74984  75562  579  NADPH-dependent FMN reductase  YP_546937  normal  0.966553  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0073  CDS  NC_007948  75959  77980  2022  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_546938  normal  0.447935  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0074  CDS  NC_007948  77980  78660  681  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_546939  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0075  CDS  NC_007948  78774  79400  627  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_546940  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0076  CDS  NC_007948  79516  80286  771  chromosome segregation ATPase  YP_546941  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0077  CDS  NC_007948  80382  80921  540  hypothetical protein  YP_546942  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0078  CDS  NC_007948  81003  81938  936  chromosome segregation DNA-binding protein  YP_546943  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0079  CDS  NC_007948  82151  82816  666  glutathione S-transferase-like  YP_546944  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0080  CDS  NC_007948  83292  84251  960  indigoidine synthase A like protein  YP_546945  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0081  CDS  NC_007948  84470  85696  1227  tetratricopeptide TPR_4  YP_546946  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0082  CDS  NC_007948  85761  86429  669  hypothetical protein  YP_546947  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0083  CDS  NC_007948  86568  87365  798  protein of unknown function DUF899, thioredoxin-like  YP_546948  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0084  CDS  NC_007948  87391  87978  588  hypothetical protein  YP_546949  normal  0.898737  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0085  CDS  NC_007948  88293  88634  342  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  YP_546950  normal  0.678342  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0086  CDS  NC_007948  88826  90343  1518  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  YP_546951  normal  0.688678  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0087  CDS  NC_007948  90837  91667  831  hypothetical protein  YP_546952  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0088  CDS  NC_007948  91762  92757  996  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  YP_546953  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0089  CDS  NC_007948  92760  93326  567  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  YP_546954  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0090  CDS  NC_007948  93350  94690  1341  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  YP_546955  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0091  CDS  NC_007948  94731  96179  1449  betaine-aldehyde dehydrogenase  YP_546956  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0092  CDS  NC_007948  96213  96974  762  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_546957  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0093  CDS  NC_007948  97094  98335  1242  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  YP_546958  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0094  CDS  NC_007948  98341  99714  1374  type III effector Hrp-dependent outers  YP_546959  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0095  CDS  NC_007948  99774  100487  714  transcriptional regulator NanR  YP_546960  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0096    NC_007948  100500  100679  180      normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0097  CDS  NC_007948  100735  101523  789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_546961  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0098  CDS  NC_007948  101791  102594  804  hypothetical protein  YP_546962  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0099  CDS  NC_007948  102896  103237  342  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  YP_546963  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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Bpro_0100  CDS  NC_007948  103719  104111  393  TraR/DksA family transcriptional regulator  YP_546964  normal  normal  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
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