190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0099 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0099  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  100 
 
 
113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  99.12 
 
 
113 aa  228  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1747  PhnA protein  86.61 
 
 
113 aa  191  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0953769  normal  0.26972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  83.04 
 
 
113 aa  191  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  82.3 
 
 
114 aa  187  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0482  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  81.42 
 
 
134 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3342  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  81.42 
 
 
114 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0257  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  81.42 
 
 
114 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3011  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  81.42 
 
 
114 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2082  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  81.42 
 
 
114 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0286  phnA family protein  81.42 
 
 
114 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0298  phnA family protein  81.42 
 
 
114 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3336  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  81.42 
 
 
114 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6268  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  78.76 
 
 
114 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940336  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7062  PhnA protein  76.99 
 
 
118 aa  175  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225206  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6554  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  77.88 
 
 
118 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1275  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  79.82 
 
 
117 aa  173  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6162  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  79.82 
 
 
117 aa  173  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6556  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  79.82 
 
 
117 aa  173  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0933451  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3747  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  69.3 
 
 
118 aa  168  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  65.52 
 
 
115 aa  156  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.18 
 
 
113 aa  140  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0240  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.34 
 
 
137 aa  140  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.77 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  55.26 
 
 
113 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.77 
 
 
113 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.77 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  58.77 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  58.77 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  56.14 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.39 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.77 
 
 
113 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.77 
 
 
113 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.77 
 
 
113 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.77 
 
 
113 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.77 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.51 
 
 
112 aa  130  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.63 
 
 
112 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1791  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.51 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758561  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1344  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  62.39 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.204916  normal  0.319142 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  53.51 
 
 
122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  54.39 
 
 
113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  57.02 
 
 
113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.26 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  57.02 
 
 
113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.91 
 
 
113 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.75 
 
 
113 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  53.91 
 
 
113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.91 
 
 
113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.91 
 
 
113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4283  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.63 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.75 
 
 
110 aa  124  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.51 
 
 
112 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.14 
 
 
113 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  52.21 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  54.55 
 
 
111 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.89 
 
 
112 aa  124  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.98 
 
 
113 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.63 
 
 
113 aa  123  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.39 
 
 
113 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  53.1 
 
 
113 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.59 
 
 
112 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.59 
 
 
112 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.98 
 
 
130 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.95 
 
 
111 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  48.67 
 
 
113 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.95 
 
 
137 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  54.39 
 
 
113 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.95 
 
 
137 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.39 
 
 
113 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  53.1 
 
 
124 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  54.05 
 
 
111 aa  120  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.78 
 
 
111 aa  120  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.51 
 
 
113 aa  120  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6473  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.75 
 
 
113 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal  0.219152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  52.59 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  53.51 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1818  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.25 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942108  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  55.26 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2382  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.1 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00334109  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2159  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.25 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.21 
 
 
113 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.51 
 
 
112 aa  118  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.24 
 
 
111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  54.39 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1165  alkylphosphonate uptake protein  52.21 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1540  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.43 
 
 
113 aa  116  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.776148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.83 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0433  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.51 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>