68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0033 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  90.5 
 
 
179 aa  348  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  77.09 
 
 
179 aa  293  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  76.54 
 
 
179 aa  293  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  55.49 
 
 
175 aa  204  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  40.83 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  38.55 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  36.31 
 
 
183 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  37.95 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  38.1 
 
 
183 aa  111  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  39.33 
 
 
177 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  35.71 
 
 
174 aa  101  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  35.96 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  35.96 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  35.96 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  34.55 
 
 
186 aa  98.2  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  35.5 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.26 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  32.58 
 
 
181 aa  84.3  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  29.86 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  27.49 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  34.57 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  34.97 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  30.61 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  28.48 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  28.67 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  34.11 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  34.13 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  31.47 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  31.43 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.2 
 
 
150 aa  55.5  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  28 
 
 
202 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.19 
 
 
134 aa  52  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  26.62 
 
 
164 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.32 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  29.66 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.08 
 
 
149 aa  48.9  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.97 
 
 
150 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  26.21 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3644  hypothetical protein  29.45 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.64826 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  24.82 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  26.28 
 
 
139 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  26.12 
 
 
135 aa  44.7  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  28.8 
 
 
158 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.14 
 
 
140 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  28.28 
 
 
172 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  25.79 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  25.79 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  26.49 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  24.67 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  25.68 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  22.96 
 
 
135 aa  42.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  25.55 
 
 
139 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 
134 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  25.19 
 
 
134 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  25.55 
 
 
139 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.55 
 
 
139 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  25.55 
 
 
139 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  25.55 
 
 
139 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1730  glyoxalase family protein  25.55 
 
 
139 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00522629  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 
135 aa  42  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  26.35 
 
 
134 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  24.84 
 
 
142 aa  41.6  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  28.24 
 
 
658 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  30.11 
 
 
182 aa  41.6  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  24.83 
 
 
134 aa  41.2  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  25.55 
 
 
139 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  25.55 
 
 
139 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>