More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0072 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  66.84 
 
 
194 aa  269  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  66.84 
 
 
194 aa  269  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  65.26 
 
 
201 aa  257  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  63.87 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  65.79 
 
 
193 aa  252  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 
189 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  44.57 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  42.22 
 
 
188 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  43.55 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 
192 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 
230 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  40.61 
 
 
192 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  40.51 
 
 
193 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
216 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  37.82 
 
 
193 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 
212 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  36.41 
 
 
197 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  39.01 
 
 
185 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  36.96 
 
 
186 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  41.13 
 
 
180 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.57 
 
 
187 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 
185 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  36.16 
 
 
186 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  35.48 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  35.33 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  30.56 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  36.87 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  35.71 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  34.57 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  32.79 
 
 
180 aa  91.3  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  32.8 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  30 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
185 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  34.83 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
186 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
185 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
185 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
185 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
185 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 
187 aa  88.6  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
186 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  35.91 
 
 
189 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  34.05 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
186 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  36.31 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  35.36 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  39.71 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 
184 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 
220 aa  85.5  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 
184 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  34.05 
 
 
183 aa  85.5  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  34.05 
 
 
183 aa  85.5  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  38.13 
 
 
197 aa  84.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
181 aa  84.7  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  35.93 
 
 
194 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
182 aa  84.3  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  33.88 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  35.68 
 
 
183 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  32.79 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  35.2 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  35.67 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  32.96 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  30.9 
 
 
184 aa  82  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  32.07 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  33.93 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  34.83 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  31.35 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  34.05 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  34.3 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  33.87 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  37.09 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  31.32 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  36.31 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 
178 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 
178 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>