More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4960 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  98.37 
 
 
184 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  93.48 
 
 
184 aa  357  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  92.93 
 
 
184 aa  354  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  92.93 
 
 
184 aa  354  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  92.93 
 
 
184 aa  354  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  90.11 
 
 
183 aa  346  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  81.62 
 
 
185 aa  310  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  81.62 
 
 
185 aa  310  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  82.12 
 
 
185 aa  309  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  81.01 
 
 
185 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  81.56 
 
 
185 aa  306  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  81.56 
 
 
185 aa  306  9e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  81.56 
 
 
185 aa  306  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  81.56 
 
 
185 aa  306  9e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  75.98 
 
 
184 aa  291  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  74.86 
 
 
183 aa  289  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  73.37 
 
 
184 aa  283  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  61.58 
 
 
184 aa  229  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  62.15 
 
 
183 aa  226  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  59.32 
 
 
183 aa  221  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  58.76 
 
 
184 aa  220  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  57.63 
 
 
184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  59.22 
 
 
183 aa  217  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  58.96 
 
 
184 aa  217  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  58.96 
 
 
184 aa  217  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  56.25 
 
 
184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  60.23 
 
 
185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  57.3 
 
 
184 aa  208  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  57.95 
 
 
182 aa  207  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  55.87 
 
 
183 aa  206  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  53.37 
 
 
182 aa  206  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  56.32 
 
 
186 aa  204  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  57.06 
 
 
183 aa  204  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  55.93 
 
 
183 aa  203  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  55.93 
 
 
183 aa  203  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  57.63 
 
 
184 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  51.38 
 
 
183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  57.06 
 
 
206 aa  198  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  51.38 
 
 
183 aa  197  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
190 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  49.45 
 
 
190 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  51.98 
 
 
183 aa  190  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  48.9 
 
 
190 aa  189  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  51.4 
 
 
186 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  48.89 
 
 
204 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  50.28 
 
 
186 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  50.87 
 
 
189 aa  187  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  50.28 
 
 
186 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  50.28 
 
 
186 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  49.15 
 
 
190 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  49.71 
 
 
190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  48.6 
 
 
182 aa  177  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  51.72 
 
 
187 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  46.67 
 
 
184 aa  174  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  47.22 
 
 
185 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  48.02 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  47.8 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  52.81 
 
 
184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  50.28 
 
 
185 aa  170  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  51.69 
 
 
189 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  46.55 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  50 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  47.16 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  44.32 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.46 
 
 
180 aa  162  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  46.33 
 
 
186 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
186 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  43.26 
 
 
188 aa  157  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  41.48 
 
 
180 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  43.02 
 
 
189 aa  155  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  46.7 
 
 
186 aa  154  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  40.33 
 
 
189 aa  153  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  41.44 
 
 
185 aa  150  8e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  45.56 
 
 
185 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  41.81 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  41.14 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
187 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  36.36 
 
 
185 aa  134  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  40.35 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
180 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.8 
 
 
187 aa  130  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
181 aa  125  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
186 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  36.22 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 
185 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  34.95 
 
 
194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
197 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  39.88 
 
 
183 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  34.95 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  34.95 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  34.95 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  35.14 
 
 
188 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  34.43 
 
 
188 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  38.67 
 
 
220 aa  110  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  41.38 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.86 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>