More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3069 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
185 aa  367  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  96.76 
 
 
185 aa  336  9e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  69.1 
 
 
180 aa  237  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  63.19 
 
 
186 aa  226  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  59.12 
 
 
183 aa  204  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  53.93 
 
 
185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  48.33 
 
 
186 aa  191  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  44.51 
 
 
186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  42.05 
 
 
189 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 
184 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 
184 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.88 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  43.9 
 
 
185 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 
192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  42.7 
 
 
184 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.11 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  40.45 
 
 
184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  40.45 
 
 
184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  40.45 
 
 
184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  40.96 
 
 
186 aa  125  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  41.38 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  40.98 
 
 
184 aa  124  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.89 
 
 
185 aa  124  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  41.38 
 
 
184 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.78 
 
 
185 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.78 
 
 
185 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.78 
 
 
185 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.78 
 
 
185 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  38.76 
 
 
183 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  36.96 
 
 
183 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.78 
 
 
185 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.78 
 
 
185 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 
185 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  39.78 
 
 
193 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  37.64 
 
 
183 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  39.66 
 
 
183 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
182 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  37.43 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
188 aa  117  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  46.58 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  35.39 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  33.89 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  35.8 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  35.8 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
188 aa  114  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  36.41 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  36.9 
 
 
188 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 
188 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 
188 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 
188 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  36.9 
 
 
188 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 
188 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 
188 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  38.33 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  36.36 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  40.1 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  36.36 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  36.36 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  36.36 
 
 
188 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  37.16 
 
 
186 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  38.2 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  35.91 
 
 
187 aa  111  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  35.83 
 
 
194 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  37.16 
 
 
186 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  38.29 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  38.07 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.71 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  38.86 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  36.93 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  37.36 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  37.08 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
182 aa  107  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  34.43 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  37.99 
 
 
220 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
203 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  36.93 
 
 
184 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  38.59 
 
 
189 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
184 aa  104  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
183 aa  104  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
183 aa  104  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  42.74 
 
 
185 aa  104  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
183 aa  104  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  40.34 
 
 
189 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 
204 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  36.93 
 
 
190 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  40.34 
 
 
194 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  38.76 
 
 
194 aa  101  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
186 aa  101  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 
183 aa  101  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  38.76 
 
 
194 aa  101  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
185 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
185 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 
185 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
192 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>