More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3083 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  51.98 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  48.35 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  48.35 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  48.35 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  49.44 
 
 		 183 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  48.9 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  49.45 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  49.45 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  47.25 
 
 		 184 aa  174  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  47.8 
 
 		 184 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  47.8 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  49.16 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  48.9 
 
 		 189 aa  170  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  48.07 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  48.31 
 
 		 183 aa  167  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  47.51 
 
 		 183 aa  167  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  46.7 
 
 		 190 aa  167  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  47.51 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  47.51 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  47.51 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  47.51 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  45.9 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  45.05 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  46.96 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  46.96 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  46.96 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  45.25 
 
 		 183 aa  164  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  46.2 
 
 		 183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  46.7 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  45.6 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  48.07 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  46.7 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  44.81 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  45.9 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  49.72 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  49.72 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  44.2 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  44.2 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  45.65 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  41.85 
 
 		 203 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  41.85 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  45.11 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  47.43 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  44.89 
 
 		 182 aa  151  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  41.3 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  43.17 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  46.63 
 
 		 188 aa  147  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  46.07 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  45.25 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  43.33 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  45.51 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  41.85 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  43.72 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  45.51 
 
 		 186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  42.62 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  43.26 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  44.94 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  43.5 
 
 		 186 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  42.05 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  43.18 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  44.63 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  41.71 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  43.72 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  39.56 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  43.02 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  41.76 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  44.38 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  34.62 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  38.2 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  33.15 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  39.55 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  37.78 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  38.67 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.08 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  38.55 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  35.52 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  36.52 
 
 		 180 aa  104  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  35.8 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  38.33 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 195 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1572  NADPH-dependent FMN reductase  44.2 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  36.69 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  38.36 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  41.3 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.33 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  36.47 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  34.41 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  44.83 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>