More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4789 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
180 aa  359  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  69.1 
 
 
185 aa  220  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  69.1 
 
 
185 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  55.31 
 
 
185 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  61.71 
 
 
183 aa  201  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  59.2 
 
 
186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  52 
 
 
186 aa  192  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  44.2 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  46.24 
 
 
184 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  46.24 
 
 
184 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  44.89 
 
 
179 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  42.37 
 
 
185 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  46.01 
 
 
186 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  41.57 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  41.57 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  40.68 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  46.01 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  41.57 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  41.24 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  41.24 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  41.24 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  41.24 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  41.24 
 
 
185 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  41.24 
 
 
185 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  41.24 
 
 
185 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
184 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  40.34 
 
 
184 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  43.71 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  41.01 
 
 
184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.11 
 
 
187 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  40.45 
 
 
184 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  38.37 
 
 
192 aa  121  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  42.59 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  39.64 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.93 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  42.6 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  36.72 
 
 
187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  36.21 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  40.24 
 
 
186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  42.37 
 
 
183 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 
190 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  35.84 
 
 
183 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  38.73 
 
 
186 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  38.55 
 
 
189 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  40.57 
 
 
188 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  38.2 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 
189 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  42.37 
 
 
194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  35.26 
 
 
183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  42.13 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  34.46 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.8 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  35.96 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  39.52 
 
 
204 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  36.57 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
183 aa  111  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  39.11 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  39.43 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  38.55 
 
 
185 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  39.18 
 
 
183 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
186 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  38.98 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  38.32 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
186 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  35.8 
 
 
182 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  38.64 
 
 
188 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  40.85 
 
 
230 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  37.85 
 
 
188 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  37.85 
 
 
188 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  37.85 
 
 
188 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  37.28 
 
 
184 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  37.85 
 
 
188 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  37.85 
 
 
194 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
185 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  35.5 
 
 
185 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  38.29 
 
 
184 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
182 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
190 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
197 aa  104  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
184 aa  104  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  38.86 
 
 
181 aa  104  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  38.07 
 
 
188 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
188 aa  103  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
188 aa  103  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
188 aa  103  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  38.07 
 
 
188 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
188 aa  103  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
188 aa  103  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
188 aa  103  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 
184 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
187 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  38.64 
 
 
183 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  35.5 
 
 
184 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
186 aa  101  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
183 aa  101  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>