More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5513 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  98.37 
 
 
184 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  94.02 
 
 
184 aa  359  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  93.48 
 
 
184 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  93.48 
 
 
184 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  93.48 
 
 
184 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  90.66 
 
 
183 aa  348  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  82.16 
 
 
185 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  82.16 
 
 
185 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  82.68 
 
 
185 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  81.56 
 
 
185 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  82.12 
 
 
185 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  82.12 
 
 
185 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  82.12 
 
 
185 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  82.12 
 
 
185 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  75.98 
 
 
184 aa  293  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  75.42 
 
 
183 aa  292  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  74.86 
 
 
184 aa  286  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  61.02 
 
 
184 aa  226  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  62.15 
 
 
183 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  58.76 
 
 
184 aa  220  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  59.32 
 
 
183 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  59.89 
 
 
183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  57.63 
 
 
184 aa  217  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  57.8 
 
 
184 aa  214  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  57.8 
 
 
184 aa  214  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  55.11 
 
 
184 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  57.3 
 
 
184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  60.23 
 
 
185 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  56.25 
 
 
186 aa  208  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  53.37 
 
 
182 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  57.39 
 
 
182 aa  205  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  55.31 
 
 
183 aa  205  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  56.74 
 
 
183 aa  203  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  55.93 
 
 
183 aa  203  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  55.93 
 
 
183 aa  203  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  52.78 
 
 
203 aa  201  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  57.63 
 
 
184 aa  201  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  50.83 
 
 
183 aa  197  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  57.06 
 
 
206 aa  197  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  50.83 
 
 
183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
190 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  49.45 
 
 
190 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  48.9 
 
 
190 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  51.98 
 
 
183 aa  191  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  51.96 
 
 
186 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  50.87 
 
 
189 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  50.28 
 
 
190 aa  188  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  50.28 
 
 
186 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  50.28 
 
 
186 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  50.28 
 
 
186 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  48.59 
 
 
204 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  49.72 
 
 
190 aa  185  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  48.6 
 
 
182 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  51.72 
 
 
187 aa  178  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  47.73 
 
 
185 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  48.02 
 
 
187 aa  174  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  46.67 
 
 
184 aa  174  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  47.8 
 
 
184 aa  174  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  50.85 
 
 
185 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  52.25 
 
 
184 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  52.25 
 
 
189 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  50.56 
 
 
194 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  46.55 
 
 
185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  47.16 
 
 
185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  44.89 
 
 
185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.9 
 
 
180 aa  162  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  46.33 
 
 
186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
186 aa  160  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  47.8 
 
 
186 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  43.26 
 
 
188 aa  158  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  40.91 
 
 
180 aa  154  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  42.05 
 
 
189 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  46.67 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  39.78 
 
 
189 aa  151  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  41.44 
 
 
185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  41.81 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  37.99 
 
 
187 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  36.93 
 
 
185 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  40.57 
 
 
184 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.34 
 
 
187 aa  134  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  40.34 
 
 
180 aa  130  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  39.18 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  36.57 
 
 
181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
186 aa  123  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  37.3 
 
 
188 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  37.85 
 
 
180 aa  121  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 
188 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  36.02 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  40.49 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  36.02 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  36.02 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  36.22 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  36.02 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 
185 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  35.52 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  34.97 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>