More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3192 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  55.8 
 
 
188 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  54.35 
 
 
188 aa  203  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  54.35 
 
 
188 aa  203  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  54.35 
 
 
188 aa  203  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  53.8 
 
 
194 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  54.1 
 
 
188 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  53.01 
 
 
188 aa  200  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  53.01 
 
 
188 aa  200  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  53.01 
 
 
188 aa  200  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  53.01 
 
 
188 aa  200  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  53.01 
 
 
188 aa  200  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  53.01 
 
 
188 aa  200  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  53.01 
 
 
188 aa  200  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  53.01 
 
 
188 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  53.04 
 
 
188 aa  197  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  52.46 
 
 
188 aa  197  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.51 
 
 
187 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  41.57 
 
 
220 aa  148  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  43.41 
 
 
193 aa  144  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  45.28 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  45.28 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  44.19 
 
 
179 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  41.14 
 
 
189 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  41.76 
 
 
192 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
190 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  39.43 
 
 
183 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  42.07 
 
 
197 aa  121  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 
186 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  40.34 
 
 
186 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  38.76 
 
 
186 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  38.76 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  38.2 
 
 
186 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  38.29 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
187 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  42.37 
 
 
180 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  42.05 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  38.29 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  38.29 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  40.49 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  38.29 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  37.64 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  40.46 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  38.86 
 
 
188 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  40.59 
 
 
186 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  35.36 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  39.31 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  38.64 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  38.55 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  40.51 
 
 
173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  42.41 
 
 
181 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  39.88 
 
 
184 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 
185 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.67 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  41.99 
 
 
194 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.46 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  41.48 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  42.33 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  42.33 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.91 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.91 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.91 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.91 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  35.91 
 
 
185 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
189 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.91 
 
 
185 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.91 
 
 
185 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  36.67 
 
 
184 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 
185 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  39.66 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  37.08 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
186 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
182 aa  107  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 
185 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  40.68 
 
 
187 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
186 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  37.79 
 
 
185 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
216 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 
184 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
185 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  38.8 
 
 
184 aa  104  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 
182 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  37.64 
 
 
185 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  40.51 
 
 
184 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
189 aa  100  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  36.87 
 
 
183 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  35.39 
 
 
186 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
184 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.1 
 
 
180 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  33.14 
 
 
184 aa  99  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 
204 aa  98.6  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  42.54 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
183 aa  98.6  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  34.16 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>