More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2403 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  60.33 
 
 		 186 aa  230  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  57.46 
 
 		 186 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  55.31 
 
 		 180 aa  202  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  55.19 
 
 		 183 aa  201  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  53.93 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  53.93 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  44.2 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  44.58 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  43.98 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  43.37 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  40.88 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  37.3 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  38.29 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  39.23 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 		 184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  39.77 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.87 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.87 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.87 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.87 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  35.43 
 
 		 220 aa  114  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.43 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  38.29 
 
 		 194 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.87 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  37.08 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  37.08 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.87 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  36.96 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  38.29 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  38.29 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  38.29 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  38.29 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  35.91 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  39.63 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  35.09 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  35.36 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  35.36 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  35.36 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  35.36 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  35.36 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  35.36 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  35.36 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  35.36 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  37.79 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  36.22 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  36.84 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.57 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  33.72 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  34.83 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  33.7 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  39.13 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  40.85 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  34.68 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  36.57 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  33.7 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  38.65 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  33.15 
 
 		 183 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  35.39 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  37.13 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  35.43 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  35.63 
 
 		 183 aa  98.6  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  35.67 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 		 190 aa  98.2  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  35.43 
 
 		 186 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  34.29 
 
 		 189 aa  97.4  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  35.83 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  34.83 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  35.39 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  34.5 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  35.5 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  34.83 
 
 		 185 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  35.43 
 
 		 184 aa  94.4  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  33.92 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>