More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0339 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
193 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  88.08 
 
 
193 aa  324  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  86.01 
 
 
193 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  82.2 
 
 
212 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  68.78 
 
 
197 aa  267  7e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  67.71 
 
 
192 aa  266  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  42.55 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  43.72 
 
 
189 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  43.81 
 
 
192 aa  134  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  42.78 
 
 
187 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  42.86 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  36.46 
 
 
192 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 
195 aa  124  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  40.1 
 
 
190 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  40.72 
 
 
195 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 
230 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  37.82 
 
 
192 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  41.53 
 
 
202 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
216 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 
194 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 
194 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  39.13 
 
 
193 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 
181 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
186 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  35.83 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  33.69 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 
188 aa  87  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  39.57 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  39.57 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 
188 aa  85.1  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 
188 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  34.2 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  35.93 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  37.59 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  37.86 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  37.86 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  37.86 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  37.86 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  32.62 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  36.03 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  35.23 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  37.41 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  37.41 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.28 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  34.2 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0154  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  35.66 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  27.23 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  31.41 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4308  NADPH-dependent FMN reductase  32.22 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  32.34 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  33.14 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36310  predicted flavoprotein  30.48 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  31.22 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  35.71 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  34.72 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  33.15 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  35.33 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  29.02 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  34.73 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  36.92 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  34.01 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.82 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.01 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  35 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1375  hypothetical protein  32.26 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.40169 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  35.33 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 
184 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00481  putative reductase  25.54 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.543235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  33.69 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  33.56 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  27.84 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>