More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2447 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0154  NADPH-dependent FMN reductase  64.04 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  56.29 
 
 		 173 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  40.83 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  42.41 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  40.94 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  40.46 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  43.54 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  39.25 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  44.29 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  44.29 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  44.29 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  44.29 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  44.29 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  44.29 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  44.29 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  38.86 
 
 		 220 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  43.57 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  41.78 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  38.86 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  42.14 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  42.14 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  42.14 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  42.14 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  42.14 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  40 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  39.24 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  39.62 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  37.13 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 		 230 aa  99  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.3 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  37.34 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  36.96 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  35.91 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  37.3 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  37.8 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  37.8 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  37.8 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  36.52 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  31.25 
 
 		 185 aa  91.7  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  39.73 
 
 		 194 aa  91.7  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  36.63 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  36.31 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  35.98 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  33.92 
 
 		 189 aa  89  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  35.8 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  37.79 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 		 192 aa  88.6  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  34.15 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  36.31 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  35.09 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  35.8 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  38.37 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  34.68 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  35.91 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  35.76 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.12 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.12 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.12 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.12 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.12 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.12 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  34.5 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  37.5 
 
 		 194 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  35.93 
 
 		 183 aa  84.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  35.33 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  43.07 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  35.76 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  32.54 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  36.25 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  36.97 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  32.74 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  37.85 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  33.93 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1572  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  34.5 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.77 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  36.97 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  34.59 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>