More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4645 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  48.89 
 
 
186 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  48.89 
 
 
185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  44.02 
 
 
188 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  43.48 
 
 
194 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  44.02 
 
 
188 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  44.02 
 
 
188 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  44.02 
 
 
188 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  45 
 
 
188 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  43.89 
 
 
188 aa  154  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  42.62 
 
 
188 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  43.33 
 
 
188 aa  151  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  43.33 
 
 
188 aa  151  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  43.33 
 
 
188 aa  151  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  43.33 
 
 
188 aa  151  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  43.33 
 
 
188 aa  151  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  43.33 
 
 
188 aa  151  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  43.33 
 
 
188 aa  151  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  43.33 
 
 
188 aa  151  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  41.57 
 
 
183 aa  148  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  44.07 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  43.98 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.21 
 
 
187 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  41.81 
 
 
189 aa  131  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.59 
 
 
181 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 
189 aa  122  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  40.12 
 
 
179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 
180 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  35.43 
 
 
185 aa  114  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 
187 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  38.67 
 
 
183 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
186 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  38.67 
 
 
184 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  38.67 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2763  NADPH-dependent FMN reductase  36.72 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  39.2 
 
 
184 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  40.7 
 
 
173 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  35.03 
 
 
186 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 
186 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  37.43 
 
 
184 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  39.2 
 
 
185 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  35.8 
 
 
185 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
183 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  35.52 
 
 
185 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
185 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.06 
 
 
185 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 
182 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.06 
 
 
185 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.06 
 
 
185 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.06 
 
 
185 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  38.86 
 
 
181 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  37.04 
 
 
194 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
189 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.06 
 
 
185 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  39.18 
 
 
185 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  37.06 
 
 
185 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.06 
 
 
185 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.36 
 
 
180 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
184 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  34.43 
 
 
185 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
186 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
186 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 
188 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  36.56 
 
 
197 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
186 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0154  NADPH-dependent FMN reductase  45.29 
 
 
181 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  38.55 
 
 
185 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
184 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
184 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  34.05 
 
 
186 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
186 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  35.52 
 
 
187 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
183 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
182 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
184 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  38.01 
 
 
183 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  39.18 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  37.99 
 
 
185 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  36.52 
 
 
182 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  35.91 
 
 
185 aa  98.2  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  32.07 
 
 
189 aa  98.2  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1444  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.43 
 
 
181 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  34.46 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 
185 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
183 aa  95.9  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  35.67 
 
 
184 aa  95.5  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  31.28 
 
 
186 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  34.97 
 
 
184 aa  95.1  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  31.72 
 
 
411 aa  94.7  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
403 aa  94.4  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0090  NADPH-dependent FMN reductase  31.49 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000795412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>