260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0194 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
192 aa  383  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  67.71 
 
 
193 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  67.37 
 
 
212 aa  261  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  67.71 
 
 
193 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  65.1 
 
 
193 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  65.22 
 
 
197 aa  244  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  42.49 
 
 
197 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  36.46 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  37.89 
 
 
188 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  38.62 
 
 
195 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  43.75 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  39.89 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  43.29 
 
 
190 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  37.3 
 
 
230 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  36.98 
 
 
195 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
216 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 
194 aa  92  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 
181 aa  88.6  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 
186 aa  87  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  41.13 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
186 aa  79  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  33.87 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  31.77 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  31.94 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  31.94 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  31.94 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  31.94 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  41.6 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  32.57 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  36.05 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  36.05 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0154  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  35.37 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  32.75 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.52 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  40.8 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  35.71 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00551  putative reductase  27.46 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  36.55 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00481  putative reductase  25.13 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.543235  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  33.56 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1375  hypothetical protein  34.46 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.40169 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  36 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1374  putative reductase  27.46 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.325485  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  34 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2185  reductase  38.18 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  34.73 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3810  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  31.1 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2763  NADPH-dependent FMN reductase  29.51 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  33.78 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00441  putative reductase  25.66 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  31.51 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  31.74 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00421  putative reductase  24.08 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  34.64 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  33.56 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  30.59 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00461  putative reductase  33.1 
 
 
174 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.677229  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0042  putative reductase  24.34 
 
 
174 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  32.89 
 
 
190 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  30.72 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2534  reductase  31.01 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  31.37 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  31.37 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  31.37 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  30.72 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  26.63 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>