More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5127 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
230 aa  470  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  41.94 
 
 
188 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  49.47 
 
 
192 aa  149  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  46.67 
 
 
189 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  40.88 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  40.32 
 
 
187 aa  132  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  40.64 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  39.9 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  43.64 
 
 
197 aa  124  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  39.36 
 
 
190 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  36.04 
 
 
216 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  41.71 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  38.22 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 
192 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  38.22 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  45.4 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
201 aa  118  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 
197 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  38.5 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  39.04 
 
 
193 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  40.12 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  43.45 
 
 
180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  37.3 
 
 
192 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  40.85 
 
 
180 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  40.85 
 
 
185 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  35.83 
 
 
186 aa  99.4  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
181 aa  99  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0154  NADPH-dependent FMN reductase  41.3 
 
 
181 aa  99  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  38.82 
 
 
185 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  39.39 
 
 
186 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.9 
 
 
187 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  37.8 
 
 
173 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  33.87 
 
 
220 aa  92  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  38.95 
 
 
193 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  39.16 
 
 
189 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
188 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  35.45 
 
 
178 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  35.45 
 
 
178 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
186 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  32.79 
 
 
192 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 
185 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 
188 aa  85.9  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 
188 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  32.4 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  37.4 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09863  hypothetical protein  31.74 
 
 
202 aa  82  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 
182 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  32.4 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  32.4 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  32.4 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  32.4 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
192 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  32.4 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  32.4 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  32.4 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1148  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148322  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  32.4 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  28.9 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  31.38 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  32.22 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  32.22 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  32.4 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  32.4 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  32.4 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  32.4 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  32.4 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  32.57 
 
 
184 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  37.8 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  29.79 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  32.93 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  31.89 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  37.59 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  32.07 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  32.6 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  30.94 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.41 
 
 
181 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  37.5 
 
 
189 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.02 
 
 
180 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  32.63 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  28.88 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3619  FMN reductase, NADPH-dependent  32.56 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  31.89 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  32.9 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
202 aa  72  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1374  putative reductase  29.88 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.325485  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  36.73 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>