More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4143 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 184 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 184 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  84.78 
 
 		 184 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  58.96 
 
 		 184 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  57.8 
 
 		 184 aa  214  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  58.38 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  58.38 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  58.38 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  56.65 
 
 		 183 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  57.8 
 
 		 184 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  56.65 
 
 		 185 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  54.24 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  54.24 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  54.24 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  54.24 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  53.67 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  53.67 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  53.67 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  55.49 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  55.31 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  52.84 
 
 		 182 aa  197  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  54.19 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  53.37 
 
 		 184 aa  194  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  53.59 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  56.18 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  50.57 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  55.06 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  55.68 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  54.49 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  54.49 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  54.49 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  53.93 
 
 		 206 aa  186  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  51.69 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  53.37 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  53.07 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  51.69 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  52.17 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  50.57 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  50.57 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  49.71 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  50.29 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  51.12 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  49.45 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  49.71 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  49.14 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  46.45 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  49.16 
 
 		 187 aa  168  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  48.91 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  47.43 
 
 		 189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  46.63 
 
 		 185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  48.02 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  46.96 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  45.51 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  45.56 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  47.51 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  46.86 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  43.33 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  45.76 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  46.86 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  46.89 
 
 		 192 aa  157  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  46.86 
 
 		 190 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  49.14 
 
 		 189 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  49.72 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  46.86 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  45.14 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  47.28 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  47.75 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  48 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  48.6 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  44.25 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.66 
 
 		 180 aa  147  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  43.26 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  42.77 
 
 		 180 aa  144  8.000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  43.11 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  46.24 
 
 		 180 aa  141  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  38.2 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  47.34 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  39.88 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.02 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  37.64 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  47.17 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  43.1 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  44.71 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  39.11 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  44.19 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  39.01 
 
 		 184 aa  121  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  40.13 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  43.18 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  47.89 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  42.24 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.12 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  37.08 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  41.84 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  40.36 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  42.33 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  41.99 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4308  NADPH-dependent FMN reductase  48.18 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>