More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03046 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  369  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  84.78 
 
 		 184 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  84.78 
 
 		 184 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  56.25 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  57.8 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  55.11 
 
 		 184 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  54.55 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  54.55 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  54.55 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  57.23 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  57.23 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  57.23 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  57.23 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  56.32 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  56.65 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  56.65 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  56.65 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  53.98 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  53.76 
 
 		 183 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  54.6 
 
 		 183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  53.93 
 
 		 184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  52.49 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  53.45 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  54.89 
 
 		 183 aa  193  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  52.87 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  51.14 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  53.37 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  53.37 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  53.93 
 
 		 184 aa  188  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  55.06 
 
 		 184 aa  187  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  55.62 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  54.49 
 
 		 206 aa  185  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  52.81 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  53.07 
 
 		 182 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  52.81 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  49.72 
 
 		 183 aa  184  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  52.43 
 
 		 184 aa  184  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  50.54 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  52.84 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  51.12 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  47.51 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  46.96 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  46.49 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  46.41 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  46.41 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  46.29 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  45.65 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  48 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  45.65 
 
 		 190 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  45.51 
 
 		 190 aa  160  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  48.65 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  47.43 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  46.45 
 
 		 192 aa  157  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  46.37 
 
 		 187 aa  157  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  45.56 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  43.65 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  43.02 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  46.33 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  41.85 
 
 		 203 aa  153  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  47.43 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  48.33 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  48 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  47.19 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  45 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  42.05 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  42.53 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  39.66 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  45.81 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  37.7 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  40.46 
 
 		 180 aa  137  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  45.16 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.51 
 
 		 180 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  41.92 
 
 		 189 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  44.32 
 
 		 185 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  40.33 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  36.16 
 
 		 185 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  43.71 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  42.29 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  38.55 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  49.3 
 
 		 197 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  38.2 
 
 		 184 aa  117  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  43.53 
 
 		 179 aa  117  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  42.7 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  41.34 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  45.93 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  41.57 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  41.81 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 		 189 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  37.02 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  39.76 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.07 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  38.8 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  37.1 
 
 		 188 aa  104  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>