More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5720 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  48.55 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.29 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  42.13 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  54.33 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  43.02 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  43.75 
 
 		 186 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  44.89 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  42.07 
 
 		 183 aa  121  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  47.89 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  47.89 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  49.3 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  43.12 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  41.51 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  40.33 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  42.46 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  39.04 
 
 		 188 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 186 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  39.13 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  36.16 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  39.63 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  39.43 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  39.77 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  32.92 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  39.16 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  40.12 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  39.77 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  40.72 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  40.72 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  40.72 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.57 
 
 		 185 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.01 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.01 
 
 		 185 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  38.01 
 
 		 185 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.01 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.01 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.01 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.01 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 182 aa  104  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  39.76 
 
 		 184 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  43.2 
 
 		 186 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  40.85 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.57 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  36.56 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.31 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0477  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 		 181 aa  101  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307827  normal  0.877798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  34.3 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  35.33 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  42.62 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  37.36 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  42.22 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  44.72 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  43.8 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  37.35 
 
 		 184 aa  99  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  38.29 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  35.33 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  35.94 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  43.61 
 
 		 185 aa  97.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  37.95 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  38.86 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  36.14 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  40.98 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  32.1 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  35.54 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2763  NADPH-dependent FMN reductase  32.02 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  40.88 
 
 		 184 aa  95.5  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  35.47 
 
 		 187 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  32.58 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  34.5 
 
 		 185 aa  94.4  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2187  NADPH-dependent FMN reductase  30.17 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  40.52 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  40.32 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  35.06 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1444  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  36.78 
 
 		 173 aa  92.8  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>