More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1480 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
179 aa  366  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.89 
 
 
187 aa  147  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  42.16 
 
 
186 aa  139  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  44.19 
 
 
183 aa  137  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  47.53 
 
 
186 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  44.89 
 
 
180 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  46.91 
 
 
185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  44.71 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  44.71 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  40.57 
 
 
186 aa  124  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  42.54 
 
 
189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  43.53 
 
 
184 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
183 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  40.12 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  40.12 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  39.66 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  38.51 
 
 
183 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  38.6 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  36.97 
 
 
194 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  39.76 
 
 
189 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  37.21 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  40.74 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
184 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.39 
 
 
181 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  38.76 
 
 
185 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  37.34 
 
 
193 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  40.12 
 
 
184 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  40.12 
 
 
184 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  40.12 
 
 
184 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  45.04 
 
 
184 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  39.66 
 
 
185 aa  104  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  35.84 
 
 
183 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.36 
 
 
185 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6301  NADPH-dependent FMN reductase  44.7 
 
 
167 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  35.56 
 
 
194 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.89 
 
 
185 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
185 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.89 
 
 
185 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
188 aa  101  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  35.56 
 
 
188 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  35.56 
 
 
188 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  35.56 
 
 
188 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  35.56 
 
 
188 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
188 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.27 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.27 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.27 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  34.48 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.27 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  35 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  35 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  36.93 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.04 
 
 
180 aa  97.4  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
188 aa  97.4  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
187 aa  97.4  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  36.05 
 
 
188 aa  97.4  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  35.12 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4080  NADPH-dependent FMN reductase  37.85 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0440178  normal  0.0878712 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  35.43 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  35.12 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  38.92 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  37.72 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  35.88 
 
 
189 aa  94  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  45.9 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  46.77 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  35.26 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1572  NADPH-dependent FMN reductase  46.92 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  37.95 
 
 
194 aa  92  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  45.16 
 
 
183 aa  92  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
188 aa  92  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  50.4 
 
 
185 aa  92  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  35.14 
 
 
187 aa  91.7  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4706  NADPH-dependent FMN reductase  43.7 
 
 
190 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3657  NADPH-dependent FMN reductase  43.7 
 
 
190 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164718  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
187 aa  91.3  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2039  NADPH-dependent FMN reductase  46.09 
 
 
195 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.343608 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3864  NADPH-dependent FMN reductase  43.7 
 
 
190 aa  90.9  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  32.58 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
190 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0413  hypothetical protein  30.56 
 
 
267 aa  89.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000247794  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  36.69 
 
 
183 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  41.09 
 
 
182 aa  89  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  35.63 
 
 
182 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4308  NADPH-dependent FMN reductase  47.66 
 
 
183 aa  89  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5403  NADPH-dependent FMN reductase  43.28 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1795  NADPH-dependent FMN reductase  46.27 
 
 
188 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709861  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1861  NADPH-dependent FMN reductase  46.27 
 
 
188 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.91747  normal  0.2434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>