More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4138 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 186 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  98.92 
 
 		 186 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  96.77 
 
 		 186 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  94.09 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  70.43 
 
 		 189 aa  264  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  69.4 
 
 		 194 aa  259  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  69.02 
 
 		 185 aa  255  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  62.37 
 
 		 187 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  66.67 
 
 		 184 aa  236  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  60 
 
 		 188 aa  230  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  60.77 
 
 		 186 aa  230  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  59.67 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  58.56 
 
 		 185 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  58.01 
 
 		 185 aa  223  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  59.67 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  63.04 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  56.45 
 
 		 187 aa  217  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  54.24 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  53.07 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  51.4 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  51.4 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  51.4 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  50.28 
 
 		 183 aa  187  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  50.28 
 
 		 183 aa  187  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  49.72 
 
 		 184 aa  187  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  50.28 
 
 		 184 aa  187  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  48.59 
 
 		 184 aa  187  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  50.28 
 
 		 184 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  49.72 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  50 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  49.72 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  49.72 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  49.72 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  49.72 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  48.07 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  49.16 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  49.16 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  50.56 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  47.46 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  49.16 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  48.91 
 
 		 182 aa  184  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  48.31 
 
 		 183 aa  184  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  47.19 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  48.88 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  50.28 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  48.62 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  47.54 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  49.45 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  50.83 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  48.62 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  47.75 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  49.71 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  49.71 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  49.18 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  49.16 
 
 		 182 aa  177  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  45.95 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  49.46 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  46.74 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  46.96 
 
 		 184 aa  171  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  44.2 
 
 		 185 aa  168  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  45.14 
 
 		 182 aa  167  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  45.11 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  44.83 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  44.32 
 
 		 189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  44.94 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  46.74 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  45.65 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  46.67 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  42.94 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  43.02 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.14 
 
 		 180 aa  147  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  41.14 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  45.51 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  42.22 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  42.13 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  42.37 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  40.33 
 
 		 181 aa  141  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  42.2 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  40.66 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 		 183 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  40 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  45.39 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  40.22 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  45.39 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  45.39 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  45.39 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  45.39 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  45.39 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  45.39 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  45.39 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  45.39 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  45.39 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>