295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4056 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  78.14 
 
 		 189 aa  276  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  76.09 
 
 		 194 aa  273  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  74.32 
 
 		 185 aa  264  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  66.67 
 
 		 186 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  66.67 
 
 		 186 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  66.67 
 
 		 186 aa  257  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  65.56 
 
 		 186 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  62.16 
 
 		 187 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  58.15 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  59.24 
 
 		 185 aa  227  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  58.38 
 
 		 188 aa  225  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  57.3 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  60.77 
 
 		 187 aa  222  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  57.07 
 
 		 186 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  62.16 
 
 		 186 aa  219  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  57.22 
 
 		 185 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  52.25 
 
 		 184 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  52.25 
 
 		 184 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  52.25 
 
 		 184 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  52.81 
 
 		 184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  52.25 
 
 		 184 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  51.12 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  51.41 
 
 		 183 aa  185  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  47.78 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  50.83 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  50.55 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  50.55 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  50.55 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  50.55 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  50 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  50 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  48.35 
 
 		 184 aa  179  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  48.07 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  47.8 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  47.49 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  47.49 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  49.45 
 
 		 184 aa  175  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  47.83 
 
 		 183 aa  174  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  49.16 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  47.22 
 
 		 184 aa  174  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  48.07 
 
 		 184 aa  174  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  45.56 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  47.22 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  48.04 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  47.28 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  46.74 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  47.49 
 
 		 183 aa  171  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  48.31 
 
 		 182 aa  171  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  47.78 
 
 		 206 aa  168  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  46.11 
 
 		 182 aa  167  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  47.75 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  47.75 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  47.19 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  47.22 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  47.22 
 
 		 190 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  50.27 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  45.56 
 
 		 190 aa  160  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  48.07 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  44.32 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  45.25 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  44.69 
 
 		 183 aa  154  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  43.48 
 
 		 182 aa  154  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  45 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  43.09 
 
 		 189 aa  151  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  44.38 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.68 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  42.78 
 
 		 190 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  44.94 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  42.13 
 
 		 204 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  39.66 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  48.73 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  40.56 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  41.76 
 
 		 184 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 		 189 aa  137  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  46.63 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  42.11 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  41.48 
 
 		 183 aa  127  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.87 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  37.99 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  43.14 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  43.14 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  43.14 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  43.14 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  43.14 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  43.14 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  41.83 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  41.83 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  41.83 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  41.83 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  41.83 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  41.83 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  41.83 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  41.83 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  41.83 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>