More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1473 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
187 aa  387  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  56.83 
 
 
187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  37.99 
 
 
184 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 
183 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
184 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  46.26 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  39.04 
 
 
183 aa  135  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  36.31 
 
 
184 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  42.08 
 
 
183 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
184 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  37.43 
 
 
185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  45.4 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  42.07 
 
 
189 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  45.4 
 
 
185 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  40.33 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  42.77 
 
 
192 aa  127  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  36.31 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  39.56 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  34.83 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  44.3 
 
 
183 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
182 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  37.3 
 
 
185 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  38.71 
 
 
185 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
184 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
184 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  40.94 
 
 
182 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.67 
 
 
187 aa  121  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  43.67 
 
 
183 aa  121  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 
184 aa  121  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  41.36 
 
 
184 aa  120  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  38.2 
 
 
183 aa  120  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  37.99 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  37.64 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  45.89 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  40.27 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  40.74 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  38.93 
 
 
183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  38.93 
 
 
183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
188 aa  117  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  39.78 
 
 
188 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1202  NADPH-dependent FMN reductase  45.16 
 
 
182 aa  117  9e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  37.16 
 
 
206 aa  117  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  36.31 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 
186 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  39.46 
 
 
188 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 
188 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 
188 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  39.46 
 
 
188 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 
188 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 
188 aa  114  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 
188 aa  114  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0100  hypothetical protein  37.5 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000132763  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  40.22 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
184 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  39.13 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  35.36 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  39.13 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  39.13 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  39.13 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
186 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
203 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  38.59 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  35.91 
 
 
186 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  38.92 
 
 
194 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
189 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  40.68 
 
 
183 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 
182 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  35.52 
 
 
184 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  37.99 
 
 
184 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  42.11 
 
 
184 aa  104  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  34.16 
 
 
189 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  35.2 
 
 
180 aa  103  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1444  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.8 
 
 
181 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
184 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 
190 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  33.9 
 
 
185 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  35.91 
 
 
185 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 
190 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  32.58 
 
 
185 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
183 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  34.43 
 
 
189 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  35.57 
 
 
189 aa  101  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
180 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
185 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>